Informatie

3.1: Zetmeelproteïneprotocol - Biologie


In deze activiteit ga je onderzoeken welke soorten voedsel zetmeel bevatten en welke soorten eiwit. Eerst moet je een manier hebben om te testen op zetmeel en op eiwit.

Deel 1: Welke indicatoroplossingen kunnen worden gebruikt om te testen op zetmeel en op eiwit?

Een indicatoroplossing is een goede test voor zetmeel als deze van kleur verandert in aanwezigheid van zetmeel, maar niet dezelfde kleurverandering vertoont in aanwezigheid van andere moleculen zoals eiwitten, lipiden of suikers. U krijgt twee indicatoroplossingen om te beoordelen of een van deze indicatoroplossingen kan worden gebruikt om op zetmeel te testen. Je zult ook evalueren of een van deze indicatoroplossingen kan worden gebruikt om op eiwitten te testen.

De benodigdheden die u beschikbaar zult hebben om de indicatoroplossingen te testen zijn:

  • Indicator Oplossing 1
  • Indicator Oplossing 2
  • Containers om te testen, plus marker en plakband om deze containers te labelen
  • Roerders; handschoenen
  • Voorbeelden die u kunt gebruiken om de indicatoroplossingen te testen:
    • Maïszetmeel
    • Sucrose = tafelsuiker
    • Gelatine (eiwit uit botten, huid, etc. van landbouwhuisdieren)
    • Plantaardige olie
    • Aardappelzetmeel
    • Water
    • Eiwitten in poedervorm (rijk aan eiwitten)

1. Vul deze tabel in.

Een indicatoroplossing die een goede test is voor eiwit zal van kleur veranderen wanneer toegevoegd aan deze voorbeelden uit de bovenstaande lijst:

Een indicatoroplossing die een goede test is voor eiwit zullen niet verander van kleur wanneer toegevoegd aan deze voorbeelden uit de bovenstaande lijst:

Tot ontwerpprocedures om te testen of elke indicatoroplossing een goede test is voor zetmeel of voor eiwit, beantwoord vraag 2 en 3. Wees specifiek.

2. Welke van de hierboven genoemde monsters gaat u gebruiken om elke indicatoroplossing te testen? Leg uit waarom u elk monster in de bovenstaande lijst opneemt of uitsluit.

3. Hoe ga je elke test evalueren? Waar ga je naar zoeken?

4. Stel dat twee groepen worden toegewezen om dezelfde indicator met hetzelfde monster te testen, maar de eerste groep meldt een kleurverandering en de tweede groep niet. Hoe kon dit gebeuren?

Om zeker te zijn van uw resultaten, moet u elke test zorgvuldig uitvoeren en herhaalde tests laten uitvoeren (d.w.z. twee groepen elke test laten uitvoeren). Er zal een groot aantal tests nodig zijn om te beoordelen of beide indicatoroplossingen kunnen worden gebruikt om op zetmeel of op eiwit te testen. Je docent leidt een discussie om een ​​klasprocedure af te spreken en wijst vervolgens specifieke tests toe aan elke studentengroep. Voordat u met uw tests begint, lees de waarschuwingen en instructies hieronder:.

Waarschuwingen:

  • Doen niet beide toevoegen indicatoroplossingen voor hetzelfde monster; gebruik elke indicatoroplossing op een ander monster in een aparte container.
  • Wees voorzichtig bij het hanteren van indicatoroplossing 1; het kan vlekken op handen en kleding veroorzaken.
  • Indicatoroplossing 2 bevat natriumhydroxide, een sterke base. Wees erg voorzichtig niet spetteren of morsen. Als u een indicatoroplossing op uzelf spat, was deze dan onmiddellijk af met water. Bel je leraar voor hulp.
  • Dragen handschoenen om jezelf te beschermen.

5. Vul de volgende tabel in om de gegevens vast te leggen voor de tests die aan uw groep zijn toegewezen.

Steekproef*

Indicator Oplossing

(1 of 2)#

Kleur van indicatoroplossing na toevoeging aan monster

Is de indicatoroplossing van kleur veranderd? (Ja of nee)

Opmerking

* Los voor elk type zetmeel, eiwitpoeder of sucrose ongeveer 1/2 ml van het monster op in ongeveer 2 ml water. Voor gelatine: los tot 1/4 ml op in ongeveer 2 ml water. Gebruik voor olie en water ongeveer 1 ml als uw monster.

# Gebruiken indicator oplossing 1, toevoegen tot 5 druppels toe aan het monster en roer. Gebruiken indicator oplossing 2, toevoegen tot 20 druppels toe aan het monster en roer. Met beide indicatoroplossingen kunt u stoppen zodra u een kleurverandering in de indicatoroplossing waarneemt. Met indicatoroplossing 2 kan de kleurverandering tot een minuut duren.

6. Gebruik de gegevens van alle studentengroepen om de volgende tabel in te vullen.

Steekproef

Is indicatoroplossing 1 van kleur veranderd?

Is indicatoroplossing 2 van kleur veranderd?

Repliceren 1

Repliceren 2

Repliceren 1

Repliceren 2

Maïszetmeel

Aardappelzetmeel

Eiwitten in poedervorm

Gelatine

sacharose

Plantaardige olie

Water

Als er verschillen zijn tussen de herhalingen van een test, zal uw klas de mogelijke redenen voor deze verschillen bespreken. Om een ​​definitief resultaat te krijgen, heeft u waarschijnlijk een extra herhalingstest nodig met de beste methode.

7. Is een van beide indicatoroplossingen een goede test voor? zetmeel? Zo ja, welke?

Vat kort het bewijs samen dat uw conclusie ondersteunt.

Welk aanvullend bewijs zou u helpen om zekerder te zijn van uw conclusie?

8. Is een van beide indicatoroplossingen een goede test voor? eiwit? Zo ja, welke?

Vat kort het bewijs samen dat uw conclusie ondersteunt.

Welk aanvullend bewijs zou u helpen om zekerder te zijn van uw conclusie?

Deel 2: Welke soorten voedsel bevatten zetmeel? Welke soorten voedsel bevatten eiwitten?

In dit deel van de activiteit evalueer je of zetmeel en eiwit worden aangetroffen in

  • Alle voedingsmiddelen die van dieren zijn afgeleid of sommige voedingsmiddelen die van dieren zijn afgeleid
  • Alle voedingsmiddelen die zijn afgeleid van planten of sommige voedingsmiddelen die zijn afgeleid van planten
  • Alle voedingsmiddelen die zijn afgeleid van dieren of planten of sommige voedingsmiddelen die zijn afgeleid van dieren of planten

9. Begin met het categoriseren van de resultaten uit deel 1 in de onderstaande tabel.

Voedsel afgeleid van dieren

Had dit voedsel zetmeel?

Bevatte dit voedsel eiwitten?

Voedsel afgeleid van planten

Had dit voedsel zetmeel?

Bevatte dit voedsel eiwitten?

10. Gebruik de resultaten samengevat in vraag 9 om een ​​hypothese te schrijven over welke soorten voedsel bevatten zetmeel (alle of sommige voedingsmiddelen van dieren en/of planten).

Gebruik de resultaten om een ​​hypothese te schrijven over welke soorten voedsel bevatten eiwit.

11. U krijgt de onderstaande voedingsmiddelen om uw hypothesen te testen. Vul kolommen 2-4 in deze tabel in om de verwachte resultaten te voorspellen; als uw hypothesen geen specifiek resultaat voorspellen, zet u een ?.

Voedsel

(met instructies om het monster voor te bereiden voor testen)

Komt dit voedsel van planten of dieren?

Verwacht u op basis van uw hypothesen dat dit voedsel het volgende bevat:

Bevat dit voer op basis van de lesresultaten:

Zetmeel?

Eiwit?

Zetmeel?

Eiwit?

Bonen (pure 2 bonen tot een pasta)

Boter (~1 ml)

Gelei (meng ~1 ml met ~½ ml water)

Brood (verkruimel ~1 ml; voeg ~½ ml water toe)

Yoghurt (~1 ml)

12. Om uw hypothesen te evalueren (vraag 10), moet u uw voorspellingen testen (vraag 11). Beschrijf kort hoe uw klas deze voorspellingen zal testen.

Er zijn een groot aantal tests nodig, dus je docent zal specifieke tests toewijzen aan elke studentengroep. Noteer de gegevens volgens de instructies van je docent. Noteer vervolgens de klasgegevens in de laatste twee kolommen van de tabel bij vraag 11 en beantwoord vraag 13 en 14.

13. Is uw hypothese over welke soorten voedsel bevatten? zetmeel ondersteund door de nieuwe gegevens? Leg uit hoe het bewijs je hypothese wel of niet ondersteunt.

Als je hypothese niet werd ondersteund, schrijf dan een nieuwe hypothese die rekening houdt met alle gegevens die je hebt.

Geef eventuele beperkingen van het bewijs en eventuele onzekerheid in uw conclusies aan. Welk aanvullend bewijs zou nuttig zijn om uw hypothese te evalueren?

14. Is uw hypothese over welke soorten voedsel bevatten? eiwit ondersteund door de nieuwe gegevens? Leg uit hoe het bewijs je hypothese wel of niet ondersteunt.

Als je hypothese niet werd ondersteund, schrijf dan een nieuwe hypothese die rekening houdt met alle gegevens die je hebt.

Geef eventuele beperkingen van het bewijs en eventuele onzekerheid in uw conclusies aan. Welk aanvullend bewijs zou nuttig zijn om uw hypothese te evalueren?


Coördinatie van mitofagie en mitochondriale biogenese tijdens veroudering in C. elegans

Verminderd mitochondriaal onderhoud in ongelijksoortige celtypen is een gedeeld kenmerk van veel menselijke pathologieën en veroudering. Hoe mitochondriale biogenese coördineert met de verwijdering van beschadigde of overtollige mitochondriën om cellulaire homeostase te behouden, is niet goed begrepen. Hier laten we zien dat mitofagie, een selectief type autofagie gericht op mitochondriën voor afbraak, raakvlakken heeft met mitochondriale biogenese om de mitochondriale inhoud en levensduur in Caenorhabditis elegans te reguleren. We vinden dat DCT-1 een belangrijke bemiddelaar is van mitofagie en een lange levensduur onder stressomstandigheden bij C. elegans. Aantasting van mitofagie brengt stressbestendigheid in gevaar en triggert mitochondriale retrograde signalering via de SKN-1-transcriptiefactor die zowel mitochondriale biogenese-genen als mitofagie reguleert door DCT-1-expressie te verbeteren. Onze bevindingen onthullen een homeostatische feedbacklus die metabolische signalen integreert om de biogenese en omzet van mitochondriën te coördineren. Ontkoppeling van deze twee processen tijdens veroudering draagt ​​bij tot overproliferatie van beschadigde mitochondriën en achteruitgang van de cellulaire functie.


3.1: Zetmeelproteïneprotocol - Biologie

Alle door MDPI gepubliceerde artikelen worden direct wereldwijd beschikbaar gesteld onder een open access licentie. Er is geen speciale toestemming nodig om het door MDPI gepubliceerde artikel geheel of gedeeltelijk te hergebruiken, inclusief figuren en tabellen. Voor artikelen die zijn gepubliceerd onder een open access Creative Common CC BY-licentie, mag elk deel van het artikel zonder toestemming worden hergebruikt, op voorwaarde dat het originele artikel duidelijk wordt geciteerd.

Feature Papers vertegenwoordigen het meest geavanceerde onderzoek met een aanzienlijk potentieel voor grote impact in het veld. Feature Papers worden ingediend op individuele uitnodiging of aanbeveling door de wetenschappelijke redacteuren en ondergaan peer review voorafgaand aan publicatie.

De Feature Paper kan ofwel een origineel onderzoeksartikel zijn, een substantiële nieuwe onderzoeksstudie waarbij vaak verschillende technieken of benaderingen betrokken zijn, of een uitgebreid overzichtsdocument met beknopte en nauwkeurige updates over de laatste vooruitgang in het veld dat systematisch de meest opwindende vooruitgang in de wetenschappelijke literatuur. Dit type paper geeft een blik op toekomstige onderzoeksrichtingen of mogelijke toepassingen.

Editor's Choice-artikelen zijn gebaseerd op aanbevelingen van de wetenschappelijke redacteuren van MDPI-tijdschriften van over de hele wereld. Redacteuren selecteren een klein aantal artikelen die recentelijk in het tijdschrift zijn gepubliceerd en waarvan zij denken dat ze bijzonder interessant zijn voor auteurs, of belangrijk zijn op dit gebied. Het doel is om een ​​momentopname te geven van enkele van de meest opwindende werken die in de verschillende onderzoeksgebieden van het tijdschrift zijn gepubliceerd.


Monstervoorbereiding voor de detectie van voedselpathogenen met moleculair biologische methoden

P. Rossmanith, M. Wagner, in het opsporen van pathogenen in de voedselketen, 2011

Differentiële centrifugatie:

Differentiële centrifugatie werkt door een stapsgewijze verhoging van de centrifugatiesnelheid. In het begin worden lagere snelheden gebruikt om de zwaardere voedseldeeltjes uit het monster te verwijderen, en de snelheid wordt vervolgens verhoogd totdat de doelen zelf zijn gepelleteerd. Neiderhauser et al. (1992) verbeterden de detectielimieten van conventionele PCR met een factor 1000 na het combineren van twee opeenvolgende centrifugatiestappen door 100 × g en 3000 × g spins te gebruiken. Detectielimieten van 10 3 tot 104 zijn aangetoond van zeevruchten en zachte kaas voor verschillende bacteriële doelwitten door eenvoudige centrifugatie in één stap met een snelheid van 9000 × g ( Wang et al., 1997 ).

De voordelen van centrifugeren zijn dat het snel, gemakkelijk en goedkoop is om uit te voeren zodra een bijpassende centrifuge beschikbaar is. De beperkingen zijn onder meer hechting van de doelen aan de voedselmatrix en co-sedimentatie van de doelen met de voedseldeeltjes, wat resulteert in een onvoldoende verkleining van de steekproefomvang.


Spurthi's AP Biologie Notebook

Spurthi Tarugu, Kavinmozhi Caldwell, Chelsea Mbakwe, Radha Dave, Navya Kondeti
Abstract:
Bijna alle levende organismen bevatten vier organische verbindingen, waarvan twee lipiden en eiwitten. Lipiden zijn opgebouwd uit één molecuul glycerol en drie moleculen vetzuren, wat resulteert in een triglyceride. Vetzuren maken lipiden apolair en kunnen niet in water oplossen. Eiwitten zijn van nature belangrijk voor elk levend organisme. Ze regelen het celproces, bieden ondersteuning en transporteren stoffen binnen een cel. Ze kunnen zelfs de vorm aannemen van enzymen en hormonen die cellen reguleren. Deze belangrijke cellen bestaan ​​uit polymeren van aminozuren waarvan de functionele groepen een carboxylgroep en een vrije aminogroep zijn. Beide organische verbindingen dragen bij aan ons leven en onze gezondheid is er sterk van afhankelijk. Weten hoe ze werken, is om de mechanica van het menselijk lichaam gedeeltelijk te begrijpen.

Invoering:

Op medisch gebied worden tegenwoordig tests uitgevoerd om de aan- of afwezigheid van een bepaalde stof te bepalen, of het nu gaat om eiwitten, koolhydraten of lipiden. Deze tests worden uitgevoerd om te zien of de persoon de vereiste telling van de stof heeft. Zoals er in het lab tests worden gedaan om de aan- of afwezigheid van iets vast te stellen, zo hebben we zowel het Carbohydrate- als het Protein/Lipid Lab benaderd. Door het gebruik van indicatoren bepaalden we de aan- of afwezigheid van organische verbindingen.

Methoden:
Koolhydraten Lab:
Deel 1 (Lugol's test voor zetmeel):
Eerst kregen we een reageerbuisrek en 5 reageerbuizen. We vulden elke reageerbuis met elk van de volgende oplossingen: glucose, zetmeel, galactose, sucrose en gedestilleerd water. Elke reageerbuis werd gevuld met ten minste 2-3 ml van één oplossing. We hebben elk reageerbuisje gelabeld met de naam van de oplossing die het reageerbuisje bevat. Daarna hebben we 2-3 ml Lugol-oplossing aan elke reageerbuis toegevoegd en deze vervolgens voorzichtig heen en weer geschud om de oplossingen te mengen. Ten slotte hebben we eventuele kleurveranderingen in onze grafiek vastgelegd.
Deel 2 (Benedicts test voor het verminderen van suiker)
Eerst kregen we een reageerbuisrek en 7 reageerbuisjes. Ze hebben elk van de reageerbuizen gelabeld met het juiste label: glucose, sucrose, maltose, zetmeel, ribose, galactose en gedestilleerd water. Vervolgens vulden we elke reageerbuis met één aangewezen oplossing. We zetten de hete plaat aan. Daarna pakten we een beker, vulden die voor de helft met water en plaatsten die op de hete plaat. Nadat we het bekerglas op de hete plaat hadden geplaatst, vulden we de reageerbuizen met ongeveer 2-3 ml van de Benedict's-oplossing. Vervolgens plaatsten we alle reageerbuisjes enkele minuten in de beker, met behulp van een klem of een geïsoleerde handschoen. We observeerden eventuele kleurveranderingen en legden onze waarnemingen vast in de tabel.

Proteïne/Lipiden Lab
Deel 1 (visuele test voor lipiden):
Eerst vulden we een petrischaal voor de helft met kraanwater. Vervolgens doen we een druppel plantaardige olie in de petrischaal met een pipet. Ten slotte hebben we de plantaardige olie in het water geobserveerd en onze waarnemingen vastgelegd.
Deel 2 (Biuret-test voor eiwitten):
Eerst kregen we een reageerbuisrek met 4 reageerbuisjes. Elke reageerbuis was gelabeld met de labels van de oplossingen die glucose, zetmeel, ei-albumine en gedestilleerd water zijn. Vervolgens plaatsten we 2-3 ml van elke oplossing in de toegewezen reageerbuis. Daarna hebben we de oplossingen omgezet in alkalische oplossingen (pH hoger dan 7) door 2-3 ml 10% natriumhydroxide toe te voegen. Vervolgens voegden we verschillende druppels 1% kopersulfaatoplossing toe aan elke reageerbuis. We schudden de reageerbuisjes zachtjes heen en weer en mengden het kopersulfaat met de alkalische oplossing. Ten slotte hebben we eventuele kleurveranderingen in onze grafiek vastgelegd.
Deel 3 (Onbekende oplossing)
Eerst kregen we een reageerbuisrek en 9 reageerbuisjes. Onze leraar gaf ons drie onbekende oplossingen, A, B en C. We vulden 3 reageerbuisjes met oplossing A, de volgende 3 met oplossing B en de laatste 3 met oplossing C. De eerste set van drie reageerbuisjes (A , B en C) werden toegediend met druppels Lugol's jodium. We schudden deze reageerbuisjes zachtjes en observeerden eventuele kleurveranderingen. We hebben onze waarnemingen vastgelegd in onze grafiek. Daarna zetten we de hete plaat aan. We dronken halverwege een beker van 500 ml en wachtten tot het water heet werd. In de volgende set van 3 reageerbuisjes (A, B en C) doen we er een paar druppels Benedict'8217s-oplossing in, schudden de reageerbuisjes voorzichtig heen en weer en dompelen alle 3 de reageerbuisjes in het kokende water. . Na een paar minuten observeerden we de kleur van de reageerbuisjes en noteerden onze waarnemingen in de tabel. We namen de laatste set van 3 reageerbuisjes (A, B en C) en deden er een paar druppels biureetreagens in. We schudden de reageerbuisjes zachtjes en observeerden de reageerbuisjes op kleurverandering. Deze waarnemingen hebben we vastgelegd in een tabel.

Resultaten
Grafiek 3-1 Resultaten voor Benedict's test voor het verminderen van suikers

Suikers Neerslag of kleurverandering Interpretatie
fructose Oranje positief voor het verminderen van suiker
sacharose blauw negatief voor het verminderen van suiker
Zetmeel blauw negatief voor het verminderen van suiker
Gedistilleerd water blauw negatief voor het verminderen van suiker

Grafiek 3-1 Resultaten voor Lugol's Test voor Zetmeel

Suikers Neerslag of kleurverandering Interpretatie
fructose geel negatief voor zetmeel
sacharose donker oranje positief voor zetmeel
Zetmeel geel negatief voor zetmeel
Gedistilleerd water geel negatief voor zetmeel

Grafiek 3-5 Resultaten van Biureet-test voor proteïne

Suikers Neerslag of kleurverandering Interpretatie
Ei-albumine Hemelsblauw Negatief voor proteïne
Glucose Lichtblauw Negatief voor proteïne
Zetmeel Turkoois Negatief voor proteïne
Gedistilleerd water Donkerblauw/Diep Paars Positief voor proteïne

Grafiek 3-6 Testen van de samenstelling van veelvoorkomende stoffen

Stof of onbekend Suiker (test van Benedictus) Lipiden Eiwitten (Biureet-testen) Zetmeel (Lugol's testen)
EEN Positief Negatief Negatief Negatief
B Negatief Negatief Positief Positief
C Negatief Positief Negatief Negatief

3-1 Koolhydraten
Wat was het doel van het opnemen van de buis met gedestilleerd water in elke test?
Het gedestilleerde water diende als controle voor het experiment. Het hielp ons de resultaten van de andere vloeistoffen in de andere reageerbuizen te vergelijken en te contrasteren met die van water.
Wat zou u hebben geconcludeerd als de buis met gedestilleerd water in beide tests een positieve reactie had vertoond?
Als de buis met gedestilleerd water een positieve reactie had vertoond, dan zou ik hebben geconcludeerd dat het monster besmet was.
Wat zou jij in dit geval hebben gedaan?
Als het monster besmet was, zou ik het besmette monster hebben verwijderd en vanaf het begin met het testen van het gedestilleerde water zijn begonnen.
Wat kun je concluderen over het verschil in rangschikking of binding van de functionele adehyde- of ketongroepen in glucose in vergelijking met sucrose?
Adehyde is samengesteld uit een keton. Wanneer we het verschil in rangschikking of binding van de functionele groep in glucose vergelijken, kunnen we zien dat adehyde en keton vitale componenten van glucose zijn. Aan de andere kant zijn die functionele groepen niet aanwezig in sucrose.
Sommige planten slaan voedsel op als suiker, terwijl andere het opslaan als zetmeel. Stel een test voor om te bepalen welke bewaarreserve wordt gebruikt in een groente die u op de markt kunt vinden?
De Benedict's8217s-test voor reducerende suiker en de lugol's-test voor zetmeel zullen helpen bepalen welke bewaarreserve in een groente op de markt wordt gebruikt. Als een bepaalde groente positief zou reageren op de Benedict'8217s-test, kunnen we concluderen dat het voedsel als suikers heeft opgeslagen. Hetzelfde geldt voor zetmeel, behalve vice versa. Met een Lugol-test zouden we kunnen bepalen of een groente voedsel opslaat als zetmeel.

3-2 Lipiden
Voeg in een petrischaal die voor de helft gevuld is met kraanwater één druppel plantaardige olie toe, hetzij met een pipet, hetzij door het water te roeren met een glazen staafje dat in de olie is gedompeld. Observeer wat er aan de oppervlakte van het water gebeurt en noteer uw waarnemingen.
De oliedeeltjes willen niet opgaan in het water. Door de dichtheid van olie en water blijft de olie zonder vermenging op het water drijven. De olie heeft een lagere dichtheid dan water. De plantaardige olie kan gemakkelijk worden onderscheiden van het kraanwater in de petrischaal.
Je hebt deze reactie van olie en water misschien in de dagelijkse ervaring waargenomen. Interpreteer je waarnemingen in termen van de structuur van het plantaardige oliemolecuul en zijn vermogen (of onvermogen) om een ​​waterstofbinding met water aan te gaan.
De plantaardige olie vermengt zich niet met het water, dus het heeft geen waterstofbinding met het water. Vanwege dit feit hebben we afgeleid dat plantaardige olie niet-polair is.
Wat kun je zeggen over de relatieve dichtheden van olie en water?
De relatieve dichtheid van olie is lager dan die van water omdat olie op water drijft.
In het licht van uw antwoord op de vorige vraag, welke andere functie dan energieopslag heeft vette blubber in een walvis?
Vette blubber in walvis, omdat het vet minder dicht is dan water, kan de walvis helpen drijven. Ook helpt blubber de walvis te isoleren.

3-3 Aminozuren en eiwitten
Als een stof een positief resultaat geeft met ninhydrine-regeant en een negatief resultaat met de Biuret-regeant, wat zou u dan concluderen over de samenstelling ervan?
Het ninhydrine-reagens test op aminozuren, terwijl het biureet op eiwitten test. Als de ninydrin-test positief is en de biureet-test negatief, dan bestaat de samenstelling uit aminozuren.

3-4 Testen van de samenstelling van veel voorkomende stoffen
Welke stoffen waren aanwezig in Onbekend #1?
In onbekende #1 was suiker de enige stof die aanwezig was.
Welke stoffen waren aanwezig in? Onbekende #2?
In onbekende #2 waren zetmeel en eiwit aanwezig.

Conclusie
Het doel van dit laboratorium was om verschillende stoffen, waaronder fructose, sucrose, gedistilleerd water uit zetmeel, glucose en ei-albumine, te testen op de aanwezigheid of afwezigheid van reducerende suikers, zetmeel, suiker, eiwitten en lipiden. In dit hele laboratorium zagen we dat de suikerfructose positief was voor het verminderen van suiker, maar negatief voor zetmeel, terwijl sucrose negatief was voor zowel het verminderen van suiker als zetmeel. Het zetmeel was negatief voor het verminderen van suiker, zetmeel en eiwitten. Zetmeel zou natuurlijk positief moeten zijn voor zetmeel, maar onze test was negatief, dus we denken dat de reageerbuis met het label "zetmeel" een andere oplossing bevatte. We leerden ook dat gedestilleerd water negatief was voor het verminderen van suikers en zetmeel, maar positief voor eiwitten. Gedestilleerd water had geen eiwitten mogen bevatten, dus we veronderstelden dat ons monster besmet was. Een ander ding dat we zagen, was dat de plantaardige olie niet-polair was omdat het niet het vermogen heeft om waterstof te binden.

Literatuur geciteerd
“LabBench.” Prentice Hall Bridge-pagina. Web. 27 sept. 2011.


Chromatine-integratielabeling voor het in kaart brengen van DNA-bindende eiwitten en modificaties met lage input

Celidentiteit wordt bepaald door de selectieve activering of silencing van specifieke genen via transcriptiefactorbinding en epigenetische modificaties op het genoom. Chromatine-immunoprecipitatie (ChIP) is de standaardtechniek geweest voor het in kaart brengen van de plaatsen van transcriptiefactorbinding en histonmodificatie. Onlangs zijn er alternatieve methoden voor ChIP ontwikkeld om tegemoet te komen aan de toenemende vraag naar epigenomische profilering met lage input. Van chromatine-integratielabeling (ChIL) gevolgd door sequencing (ChIL-seq) is aangetoond dat het bijzonder nuttig is voor epigenomische profilering van monsters met een lage input of zelfs afzonderlijke cellen, omdat de techniek de genomische doelsequentie vóór cellysis versterkt. Na labeling van het doeleiwit of modificatie in situ met een oligonucleotide-geconjugeerd antilichaam (ChIL-probe), wordt de nabijgelegen genoomsequentie geamplificeerd door Tn5-transposase-gemedieerde transpositie gevolgd door T7 RNA-polymerase-gemedieerde transcriptie. ChIL-seq maakt de detectie van de lokalisatie van het antilichaamdoel onder een fluorescentiemicroscoop en op genomisch niveau mogelijk. Hier beschrijven we het gedetailleerde protocol van ChIL-seq met beoordelingsmethoden voor de belangrijkste stappen, waaronder ChIL-sondereactie, transpositie, in situ transcriptie en sequencing-bibliotheekvoorbereiding. Het protocol duurt meestal 3 d om de sequencing-bibliotheek voor te bereiden, inclusief nachtelijke incubaties voor de ChIL-sondereactie en in situ transcriptie. De ChIL-sonde kan afzonderlijk worden voorbereid en enkele maanden worden bewaard, en de voorbereidings- en evaluatieprotocollen worden ook in detail gedocumenteerd. Een optionele analyse voor meerdere doelen (multitarget ChIL-seq) wordt ook beschreven. We verwachten dat het hier gepresenteerde protocol de ChIL-techniek breder toegankelijk zal maken voor het analyseren van kostbare monsters en verdere toepassingen zal vergemakkelijken.


Biochemie. 5e editie.

Eiwitten zijn de meest veelzijdige macromoleculen in levende systemen en vervullen cruciale functies in vrijwel alle biologische processen. Ze werken als katalysatoren, ze transporteren en slaan andere moleculen zoals zuurstof op, ze bieden mechanische ondersteuning en immuunbescherming, ze genereren beweging, ze geven zenuwimpulsen door en ze controleren groei en differentiatie. Veel van deze tekst zal inderdaad gericht zijn op het begrijpen wat eiwitten doen en hoe ze deze functies uitvoeren.

Verschillende belangrijke eigenschappen stellen eiwitten in staat deel te nemen aan zo'n breed scala aan functies.

Eiwitten zijn lineaire polymeren die zijn opgebouwd uit monomeereenheden die aminozuren worden genoemd. De constructie van een breed scala aan macromoleculen uit een beperkt aantal monomeerbouwstenen is een terugkerend thema in de biochemie. Is de eiwitfunctie afhankelijk van de lineaire volgorde van aminozuren? De functie van een eiwit is direct afhankelijk van zijn driedimensionale structuur (Figuur 3.1). Opmerkelijk is dat eiwitten zich spontaan opvouwen tot driedimensionale structuren die worden bepaald door de volgorde van aminozuren in het eiwitpolymeer. Dus, eiwitten zijn de belichaming van de overgang van de eendimensionale wereld van sequenties naar de driedimensionale wereld van moleculen die in staat zijn tot diverse activiteiten.

Eiwitten bevatten een breed scala aan functionele groepen. Deze functionele groepen omvatten alcoholen, thiolen, thioethers, carbonzuren, carboxamiden en een verscheidenheid aan basische groepen. Wanneer gecombineerd in verschillende sequenties, is deze reeks functionele groepen verantwoordelijk voor het brede spectrum van eiwitfunctie. De chemische reactiviteit die met deze groepen is geassocieerd, is bijvoorbeeld essentieel voor de functie van enzymen, de eiwitten die specifieke chemische reacties in biologische systemen katalyseren (zie hoofdstuk 8�).

Eiwitten kunnen met elkaar en met andere biologische macromoleculen interageren om complexe assemblages te vormen. De eiwitten in deze samenstellingen kunnen synergetisch werken om mogelijkheden te genereren die niet worden geboden door de afzonderlijke componenteiwitten (Figuur 3.2). Deze assemblages omvatten macromoleculaire machines die de nauwkeurige replicatie van DNA, de overdracht van signalen binnen cellen en vele andere essentiële processen uitvoeren.

Sommige eiwitten zijn vrij rigide, terwijl andere een beperkte flexibiliteit vertonen. Stijve eenheden kunnen functioneren als structurele elementen in het cytoskelet (de interne steigers in cellen) of in bindweefsel. Delen van eiwitten met beperkte flexibiliteit kunnen fungeren als scharnieren, veren en hefbomen die cruciaal zijn voor de eiwitfunctie, voor de assemblage van eiwitten met elkaar en met andere moleculen tot complexe eenheden, en voor de overdracht van informatie binnen en tussen cellen (Figuur 3.3).

Figuur

Kristallen van menselijke insuline. Insuline is een eiwithormoon dat cruciaal is voor het op peil houden van de bloedsuikerspiegel. (Hieronder) Kettingen van aminozuren in een specifieke volgorde (de primaire structuur) definiëren een eiwit zoals insuline. Deze kettingen vouwen in goed gedefinieerde (meer.)

Afbeelding 3.1

Structuur dicteert functie. Een eiwitcomponent van de DNA-replicatiemachinerie omringt een deel van de dubbele DNA-helix. Door de structuur van het eiwit kunnen grote DNA-segmenten worden gekopieerd zonder dat de replicatiemachinerie loskomt van de (meer.)

Afbeelding 3.2

Een complexe eiwitassemblage. Een elektronenmicrofoto van insectenvluchtweefsel in dwarsdoorsnede toont een hexagonale reeks van twee soorten eiwitfilamenten. [Met dank aan Dr. Michael Reedy.]

Afbeelding 3.3

Flexibiliteit en functie. Bij het binden van ijzer ondergaat het eiwit lactoferrine conformationele veranderingen waardoor andere moleculen onderscheid kunnen maken tussen de ijzervrije en de ijzergebonden vormen.

  • 3.1. Eiwitten zijn opgebouwd uit een repertoire van 20 aminozuren
  • 3.2. Primaire structuur: Aminozuren zijn gekoppeld door peptidebindingen om polypeptideketens te vormen
  • 3.3. Secundaire structuur: Polypeptideketens kunnen worden gevouwen tot reguliere structuren zoals de alfa-helix, het bètablad en bochten en lussen
  • 3.4. Tertiaire structuur: in water oplosbare eiwitten vouwen zich op tot compacte structuren met niet-polaire kernen
  • 3.5. Quaternaire structuur: polypeptideketens kunnen worden samengevoegd tot structuren met meerdere subeenheden
  • 3.6. De aminozuurvolgorde van een eiwit bepaalt zijn driedimensionale structuur
  • Samenvatting
  • Bijlage: Zuurbasisconcepten
  • Problemen
  • Geselecteerde metingen

In overleg met de uitgever is dit boek toegankelijk via de zoekfunctie, maar kan niet worden doorgebladerd.


Amylase op zetmeellab

In dit experiment zul je de werking van het enzym observeren amylase op zetmeel. Amylase verandert zetmeel in een eenvoudigere vorm: de suiker maltose, die oplosbaar is in water. Amylase is aanwezig in ons speeksel en begint in te werken op het zetmeel in ons voedsel terwijl het nog in de mond is.
Blootstelling aan hitte of extreme pH (zuur of base) zal denatureren eiwitten. Enzymen, waaronder amylase, zijn eiwitten. Als het gedenatureerd is, kan een enzym niet langer als katalysator voor de reactie fungeren.
Benedict's oplossing is een testreagens dat positief reageert met eenvoudige reducerende suikers zoals maltose, maar niet reageert met zetmeel. Een positieve test wordt waargenomen als de vorming van een bruinrood cupro-oxide-neerslag. Een zwakkere positieve test zal geel tot oranje zijn.

Toevoegen 1g van maizena naar een beker met 100ml van koud gedestilleerd water. Verwarm het mengsel onder regelmatig roeren tot het begint te koken. Laat afkoelen.

1. Vul het bekerglas van 250 ml voor ongeveer 3/4 met water en plaats het op de hete plaat voor een kokend waterbad. Houd het water GEWOON AAN HET KOKEN.

2. Markeer 3 reageerbuizen EEN, B en C. “Spit'8221 tussen 1 en 2 ml van speeksel in elke reageerbuis.

3. In buis EEN, toevoegen 2 ml van azijn. In buizen B en C, toevoegen 2 ml van gedestilleerd water. Klop de buizen om te mengen.

4. Plaats buis B in het kokendwaterbad voor 5 minuten. Haal ze na vijf minuten uit het bad en plaats ze terug in het reageerbuisrek.

5. Toevoegen 5 ml van de zetmeeloplossing aan elke buis en klop om te mengen. Laat de buizen zitten voor 10 minuten, af en toe op de buizen bonzen om te mengen.

6. Toevoegen 5 ml van Benedict's 8217s-oplossing aan elke buis en klop om te mengen. Plaats de buizen in het warmwaterbad. De reactie duurt enkele minuten om te beginnen.

Buis EEN: Zetmeel + speeksel behandeld met azijn (zuur)

Wat betekent dit? __________________________________________________

Buis B: Zetmeel + speeksel en water, behandeld in een kokend waterbad

Wat betekent dit? __________________________________________________

Buis C: Zetmeel + speeksel

Wat betekent dit? __________________________________________________

1. Wat is de functie van een enzym?

2. Waar hecht een substraat aan een enzym?

3. Als er een enzym aanwezig is in een reactie, is er minder ________________ _________________ nodig om de reactie op gang te brengen.

4. Wat is een veelvoorkomend achtervoegsel aan het einde van de meeste biologische enzymen?

5. De meeste enzymen zijn macromoleculen die ________________ worden genoemd.

6. Definieer denaturatie van eiwitten.

7. Noem 3 dingen die een enzym kunnen denatureren of ontvouwen.

8. Welk zwak zuur denatureerde in dit laboratorium het eiwit?

9. Wat was het doel van het plaatsen van één reageerbuis in een heetwaterbad?


Bekijk de video: PO ethologie Biologie gedrag kangoeroe (December 2021).