Informatie

Waarom is de DNA-codontabel "gelijk" aan de RNA-codontabel?


Let vooral op de dubbele aanhalingstekens op "gelijk" in de titel - ik weet dat ze niet gelijk zijn, maar u zult het zo meteen begrijpen.

Als ik naar de DNA-codontabel hier of op wikipedia kijk, en naar de RNA-codontabel hier of op wikipedia, is hun enige verschil dat de eerste thymine (T) heeft en de laatste uridine (U). Maar ik begrijp niet hoe alle andere nucleotiden hetzelfde zijn. Houd er rekening mee dat transcriptie DNA leest van 3'->5' en translatie leest mRNA van 5'->3'.

Kijk naar dit voorbeeld, gericht op de 3'-TAC-5' van de antisense streng.

De 3'-TAC-5' codeert voor tyrosine volgens de DNA-codontabel. Het transcribeert en vertaalt echter 3'-TAC-5' -> 5'-AUG-3' -> Methionine.

Focus nu op het corresponderende codon in de sense-streng, 5'-ATG-3', die codeert voor Valine volgens de DNA-tabel (deze wordt afgelezen van 3' naar 5'). Dit codon transcribeert en vertaalt 3'-GTA-5' -> 5'-CAU-3' -> Histidine, niet Valine en niet Methionine.

Dus mijn vragen zijn:

  1. Waarom laten DNA-codontabellen de overeenkomst zien tussen codons en aminozuren in de sense-strengen (5'-ATG-3'), als de enige manier om van ATG naar Met te gaan, zoals in de figuur, is om de antisense-streng te beschouwen?
  2. Ik kan zien dat het AUG-codon zich vertaalt naar Methionine, en het wordt vertaald door het 3'-TAC-5'-codon in de antisense-streng te lezen, waarvan het overeenkomstige codon in de sense-streng 5'-ATG-3' is. Maar deze laatste wordt gelezen van 3'->5', dus 3'-GTA-5' -> 5'-CAU-3' -> His.

Ik vermoed dat ik hierin veel dingen verkeerd begrijp... Misschien op de manier waarop ik de tabellen lees: ik houd er altijd rekening mee dat transcriptie wordt gelezen 3'->5' en dit is de volgorde die ik aanneem om DNA te lezen tafels.

Bedankt en sorry als ik verwarrend was.


Ik begrijp je verwarring, maar het is allemaal logisch. Het basisidee is dat wat we de 'antisense'-streng noemen, eigenlijk degene is die wordt getranscribeerd. Maar aangezien dat in feite een spiegelbeeld is, is het veel eenvoudiger om in termen van de zintuiglijke streng te denken.

Om een ​​heel eenvoudig voorbeeld te nemen:

5' ATG 3' <-- sense streng 3' TAC 5' <-- antisense streng

De antisense streng wordt gelezen in een 3' naar 5' richting:

3' TAC 5' <-- antisense streng 5' AUG 3' <-- mRNA

Omdat het mRNA een spiegelbeeld is, heeft het de volgorde van de sense-streng. Het is dit mRNA dat vervolgens wordt vertaald en dit wordt gelezen in een 5'-naar 3'-richting. AUG wordt dus vertaald als Met. Bekijk ter illustratie deze afbeelding van Wikipedia (klik erop voor een grotere versie),

In de afbeelding hierboven zie je de groeiende polypeptideketen (eiwit) zich een weg banen door het ribosoom. De vliegende blauwe dingen zijn tRNA-moleculen en de zwarte ketting onderaan is het mRNA dat wordt vertaald. Je kunt het op deze afbeelding niet echt goed zien, maar als je naar het origineel kijkt, kun je duidelijk zien dat het van rechts naar links beweegt. De rechterkant is het 5'-uiteinde en de linkerkant is de 3'. Of, in een meer statische versie (vanaf hier aangepast):

Dus de antisense streng wordt gelezen, getranscribeerd naar RNA (dat de sequentie heeft van de sense-streng maar met T omgezet in U) en het is dit mRNA dat wordt gelezen (in een 5'-naar 3'-richting) om het eiwit te produceren.


Genetische code en codons worden altijd gebruikt met verwijzing naar RNA. Als we het over DNA hebben, wordt de sense-streng van een gen beschouwd als de sequentie ervan. De anti-sense streng is echter de matrijs voor mRNA-synthese, maar vertegenwoordigt niet het gen.

De DNA-codontabel heeft simpelweg U vervangen door T. Afgezien van een wikipedia-artikel, vind ik de term niet in de volksmond (niet in de volksmond) ergens anders gebruikt.


Bekijk de video: How to read a codon table (December 2021).