Informatie

Is er een gratis alternatief voor Gelcompar voor het vergelijken van bandpatronen van meerdere gels?


Om mijn microbiële gemeenschapsmonsters van mijn experimenten via DGGE te laten lopen, moest ik meerdere gels gebruiken.

Het is dus noodzakelijk om bandpatronen over meer dan één gel te vergelijken. Dit betekent dat ik een manier nodig heb om te beoordelen of de 4e band op gel #1 dezelfde OTU is als de 4e band op gel #2.

De industriestandaard voor deze procedure lijkt de Gelcompar-software te zijn. Helaas is deze software meer dan $ 10.000 en is het eigendom (dus niet open science-vriendelijk).

Bestaat er een gratis (idealiter zoals in spraak en bier) alternatief voor Gelcompar?


Probeer deze

Pavel, A. B. & Vasile, C. I. PyElph - een softwaretool voor analyse van gelafbeeldingen en fylogenetica. BMC Bioinformatica 13, 9+ (2012).

U kunt hier downloaden http://sourceforge.net/projects/pyelph/


Bekijk de video: Setting out of building (December 2021).