Informatie

Is het mogelijk dat er geen gen op een locus zit?


"de locatie van een bepaald gen op een chromosoom" is de definitie die ik ken voor locus. ı lees net dat een gen niet per se op een locus aanwezig is. hoe zou dat mogelijk zijn?


Een locus is niet noodzakelijk de positie van een gen. Het is een positie in het genoom, of er wel of niet een gen op deze positie zit. Een locus verwijst vaak naar de positie van een SNP (die mogelijk buiten een coderend gebied ligt) of een ander type genetische marker.

Een gen wordt typisch gedefinieerd als een sequentie die codeert voor een eiwit. Het grootste deel van een eukaryoot genoom, zoals het menselijk genoom, bestaat niet uit sequenties die coderen voor eiwitten. Het is eerder gemaakt van verschillende regulerende sequenties, introns en vooral repetitief DNA. Dus als je willekeurig een sequentie in het menselijk genoom kiest, is de kans groot dat het geen sequentie wordt die wordt vertaald.


Zoals je in je vraag zei - "locus" betekent locatie. Een locus kan zich overal op een chromosoom bevinden - een hele "gen"-coderende locus, een niet-coderende locus (junk-DNA), een locus van een regulerende sequentie (voorbeeld - het promotorgebied van een gen), of slechts een enkele nucleotide-locus (SNP ) enz. Een "locus" is de locatie van belang op het chromosoom.

Ja, het is ook mogelijk dat een genetische "locus" afwezig is als deze verloren is gegaan door een "deletie". Een deletie is een type mutatie. Ze kunnen een deletie van een enkele nucleotide zijn of een zeer grote deletie van duizenden nucleotiden. Genetische deleties kunnen op verschillende natuurlijke manieren gebeuren (bijvoorbeeld een DNA-reparatiefout), en door andere mechanismen, maar ook door "door de mens gemaakte" genetische manipulaties.


Locus betekent gewoon locatie, net zo (niet-)specifiek als bij elk ander gebruik van het woord.

Onthoud dat het woord afkomstig is van traditionele genetische studies, die niet wisten hoe genen werken. Destijds gaven wetenschappers een naam aan "dat gebied in het genoom" en bepaalden ze de geschatte positie ten opzichte van andere bekende loci door middel van recombinatiestudies. Voor veel hiervan zijn we er achteraf achter gekomen dat alle bevindingen van deze oudere onderzoeken gerelateerd waren aan een specifiek gen en nu verwijzen we naar dat gen met de naam die oorspronkelijk voor de locus werd gebruikt. Als je oudere kranten leest over de wit gen in Drosophila, zul je dit gebruik zien.

Bij gewervelde dieren bevinden functioneel verwante genen zich vaak dicht bij elkaar (in een cluster) en het is handig om een ​​naam voor de hele groep te hebben. De functie van sommige transcriptiefactoren kan bijvoorbeeld afhangen van hoe de genen in het genoomgebied zijn gerangschikt. Een voorbeeld is de menselijke bètaglobinelocus.

Zelfs als een locus zoiets als een "gen" bevat, is het misschien geen traditioneel eiwitcoderend gen, maar eerder een miRNA (of andere zoals tRNA, rRNA) locus. Deze clusteren soms weer.

De sequentie op die plek in het genoom hoeft op geen enkele manier functioneel te zijn. Voor DNA-fingerprinting zou u het aantal VNTR-herhalingen op elke VNTR-locus kunnen bepalen.

En tot slot, zoals Remi.b vermeldt, kan "locus" heel specifiek verwijzen naar een enkele positie binnen de sequentie van een gen.


Bekijk de video: Hef, Kevin, Joa, Rich Kalashh, Boechi u0026 Rotjoch in Rookworst de Podcast (Januari- 2022).