Informatie

MLE-schatting met Mk-model in aap of phangorn?


Is het mogelijk om het vervangingsmodel op Mk in te stellen wanneer u MLE doet met het R-pakket ape of phangorn? Zo ja, hoe doet men dit?


Na het lezen van de documentatie blijkt het Mk-model niet beschikbaar te zijn.

Hoewel het JC69-model is, dat deze bron beschrijft als een iets minder algemene vorm als Mk. Het JC69-model gaat nog steeds uit van gelijke substitutiesnelheden en gelijke basisfrequenties. Om het JC69-model in phangorn te gebruiken, stelt u het model in op "JC" en in ape stelt u het model in op "JC69".


Het R-pakket diversitree heeft een groot aantal modellen inclusief functies om te optimaliseren onder Mk. Misschien daar eens naar kijken.


Bekijk de video: ФАНГОРН - Обзор мода Властелин колец MINECRAFT BETA #22 (November 2021).