Informatie

Een moleculaire marker voor wereldwijde eiwitsynthese


Ik weet dat eiwitsynthese door veel factoren wordt bepaald (ik bestudeer voornamelijk de mTOR-route), maar ik ben op zoek naar een soort marker die de globale eiwitsynthesesnelheden aangeeft.

Ik weet dat er weefselspecifieke markers zijn (zoals actine/myosine in spieren), maar ik zou graag iets meer willen dat alomtegenwoordig is en evenredig is met de wereldwijde eiwitproductie (misschien kan een spier meer of minder myosine maken, afhankelijk van of er enkele factoren zijn ).

Ik neem aan dat eiwitsynthesefactoren (zoals mTOR, S6K1 enz.) snel worden gereguleerd, zodat ze niet als markers kunnen worden gebruikt.

Dus, wat zou de beste moleculaire marker zijn?


Het antwoord zal je niet bevredigen. De waarheid is dat geen enkele eiwitmarker het zal doen.

Aan de ene kant lijkt het alsof je naar een individueel, representatief eiwit kijkt, dat je zou kunnen meten door middel van immunoblot. Maar de meeste eiwitten zijn in geringe concentraties, net zoveel als nodig voor hun werk, en gaan op en neer, afhankelijk van hun specifieke rol, in plaats van op algemene metabolische trends. Zelfs als een of ander algemeen controlemechanisme de eiwitsynthese over de hele linie verhoogt, zijn eiwitten in een cel 20% actine, 20% tubuline, 0,0001% 4E-BP en 0,0001% p70-S6K (verzonnen getallen ter wille van het voorbeeld). Een totale eiwittoename van 1% die u wilt meten, zou 200.000 gemakkelijker te detecteren zijn in tubuline dan in p70-R6K. Om een ​​marker te zijn voor algemene controle van eiwitsynthese, moet het markereiwit dat u wilt meten een overvloedig eiwit zijn, met weinig tot geen specifieke controle.

Aan de andere kant zijn dat de kenmerken van een huishoudgen. U kunt zo'n "representatieve" vlek dus niet normaliseren! Door het huishouden te normaliseren door het huishouden, heb je vrijwel geen wisselgeld.

Omarm labelexperimenten. Zelfs daar is de juiste normalisatie discutabel. Het feit dat iedereen dat doet, in plaats van naar proteïne X te kijken, zou in ieder geval een indicatie moeten zijn van hoeveel moeite je zult hebben om punten over de eiwitsynthesesnelheid te bewijzen met iets anders.


Gebruik van een negatieve selecteerbare marker voor snelle selectie van recombinant vacciniavirus

Het vacciniavirus is een krachtig hulpmiddel geweest in de moleculaire biologie en de ontwikkeling van vaccins. Het relatieve gemak van het inbrengen en tot expressie brengen van vreemde genen in combinatie met zijn brede gastheerbereik heeft het tot een aantrekkelijk antigeenafgiftesysteem gemaakt tegen veel heterologe ziekten. Er zijn veel verschillende benaderingen ontwikkeld om recombinant vacciniavirus te isoleren dat is gegenereerd uit homologe recombinatie, maar de meeste zijn tijdrovend en vereisen vaak een reeks passages of specifieke cellijnen. Hierin introduceren we een snelle methode voor het isoleren van recombinanten met behulp van het antibioticum coumermycine en de interferon-geassocieerde PKR-route om te selecteren op vacciniavirusrecombinanten. Deze methode maakt gebruik van een negatieve selectiemarker in de vorm van een fusie-eiwit, GyrB-PKR, bestaande uit het coumermycine-dimerisatiedomein van Escherichia coli-gyrase-subeenheid B gefuseerd met het katalytische domein van menselijk PKR. Coumermycine-afhankelijke dimerisatie van dit eiwit resulteert in activering van PKR en de fosforylering van translatie-initiatiefactor, eIF2α. Fosforylering van deze factor leidt tot een remming van de eiwitsynthese en een remming van de virusreplicatie. In aanwezigheid van coumermycine worden recombinanten geïsoleerd vanwege het verlies van dit voor coumermycine gevoelige gen door homologe recombinatie. We tonen aan dat deze selectiemethode zeer efficiënt is en beperkte verrijkingsrondes vereist om recombinant virus te isoleren.


Eiwitsynthese: controle van eiwitsynthese | Biologie

(i) Een mechanisme voor de controle van eiwitsynthese door Adenovirus VA RNAI:

Bij afwezigheid van VA mislukt het RNAI-eiwitsyntheseproces in met adenovirus geïnfecteerde HeLa-cellen. Dit komt door een gebrekkige initiatie. Het defect is het gevolg van fosforylering van de initiatiefactor elF-2 op zijn alfa-subeenheid.

Het eiwitkinase is verantwoordelijk als de door DSRNA geactiveerde remmer van eiwitsynthese (DAI) die in niet-geïnfecteerde staat aanwezig is. Het wordt geactiveerd in cellen die zijn geïnfecteerd met de adenovirusmutant Ad5 dl331, die geen VA-RNAI produceert, maar niet in cellen die zijn geïnfecteerd met wildtype virus.

Activering vindt plaats tijdens de late fase van infectie met het mutante virus en de activator lijkt DSRNA te zijn dat wordt geproduceerd door symmetrische transcriptie van het virale genoom. VA RNAI antagoneert de activering van DAI door DSRNA, maar kan de activiteit van DAI niet remmen zodra het eenmaal is geactiveerd.

(ii) Translationele controle van eiwitsynthese als reactie op hitteschok in D. Melanogaster-cellen:

Als reactie op verhoogde temperatuur synthetiseren Drosophila-cellen een kleine set eiwitten. Dit staat bekend als de heat-shock-eiwitten, terwijl de synthese van de meeste andere eiwitten stopt. In vitro translatie is gebruikt om aan te tonen dat de boodschapper-RNA's die coderen voor het normale (25) spectrum van eiwitten niet worden afgebroken of onomkeerbaar worden geïnactiveerd als reactie op de temperatuurverandering.

Tijdens de hitteschok worden alleen de hitteschok-mRNA's plus een klein aantal reeds bestaande mRNA's vertaald, terwijl de meeste andere berichten worden opgeslagen en opnieuw kunnen worden geactiveerd bij terugkeer van de cellen naar hun normale temperatuur. Cellen vertalen zowel het normale mRNA als het resterende hitteschok-mRNA na herstel van een hitteschok.

De translatiecontrole die in intacte cellen werkt, is gereproduceerd in celvrije translatiesystemen die worden aangestuurd door gezuiverd mRNA van normale en door warmte geschokte cellen. Lysaten bereid uit door warmte geschokte Drosophila-cellen vertaalden bij voorkeur de warmteschokberichten, terwijl het lysaat gemaakt van normaal groeiende Drosophila-cellen zonder onderscheid zowel normale als warmteschokberichten vertaalde.

Er moeten stabiele veranderingen zijn in de translatiecomponenten van cellen met een warmteschok die selectieve translatie van de warmteschokberichten kunnen veroorzaken. Er moet informatie zijn gecodeerd in de hitteschokberichten waarmee ze kunnen worden geselecteerd.

(iii) Controle van eiwitsynthese in reticulocytlysaten door Haemin:

Wanneer ijzer in het incubatiemedium ontbreekt, is de EIWITsynthese in intacte reticulocyten ernstig beperkt en kan worden hersteld door de toevoeging van haemine l, 2. In het lysaat dat van dergelijke cellen wordt afgeleid, wordt eiwit gesynthetiseerd met een snelheid die vergelijkbaar is met die in intacte cellen3, maar stopt abrupt na een paar minuten tenzij haemine wordt toegevoegd 4,5.

Haemine lijkt te werken door het vermogen van het lysaat om eiwitsynthese te initiëren te stabiliseren, omdat bij afwezigheid van toegevoegd hemine, polysomen verdwijnen en hun bijbehorende ontluikende ketens worden vrijgegeven4. Er is goed bewijs dat natieve subeenheden en methionyl-t-RNAF direct betrokken zijn bij het proces van initiatie6-9.

(iv) Controle van eiwitsynthese tijdens vroege splitsing van schapenembryo's:

De totale eiwitsynthese is constant hoog tijdens de eerste 2 splitsingsdelingen, daalde met 95% in de 3e celcyclus, bleef laag in de 4e en nam weer toe in de 5e cyclus. De studies geven aan dat de volledige activering van transcriptie in schapenembryo's plaatsvindt in de 4e celcyclus.

(v) De mTOR-route bij de controle van proteïne Synthese:

Aminozuren, insuline en groeifactoren activeren de signalering via het zoogdierdoelwit van rapamycine (mTOR) en worden aangetast door een tekort aan voedingsstoffen of energie. mTOR speelt een sleutelrol in de celfysiologie. mTOR reguleert talrijke componenten die betrokken zijn bij de eiwitsynthese. Deze initiatie- en verlengingsfactor en de biogenese van ribosomen zelf.


Het verouderende ademhalingssysteem - Longstructuur, functie en neurale controle

9.2 Het endoplasmatisch reticulum: potentiële bron van degeneratieve structurele veranderingen en doelwit voor toekomstige therapieën

Het ER speelt een cruciale rol bij de biosynthese van lipiden, de opslag en afgifte van calcium en bij het vouwen van eiwitten. Bij normale veroudering, verouderingsgerelateerde dementie, de ziekte van Alzheimer, Parkinson en hersenverspillende ziekten is een gemeenschappelijke factor het optreden van de ongevouwen eiwitrespons (UPR) in de spoedeisende hulp, waarbij de effectiviteit van opvouwbare eiwitten (begeleiders) , worden andere enzymen die eiwitvouwing (foldasen) en vouwsensoren vergemakkelijken, verminderd. De resulterende accumulatie van onoplosbare, verkeerd gevouwen eiwitten als fibrillen of plaques veroorzaakt een ER-stressrespons die uiteindelijk kan leiden tot cellulaire apoptose in alle soorten weefsel (Brown en Naidoo, 2012). Met de snel groeiende kennis van hoe UPR en ER-stress leiden tot celstoringen en dood bij ouderen, zijn therapeutische benaderingen die vroeg bewijs van eiwitmisvouwing detecteren en correcte vouwing van ER-eiwitten bevorderen, te verwachten (Brown en Naidoo, 2012) en bieden hoop dat ze kunnen de degeneratieve veranderingen in het longparenchym, de intercostale spieren en de bovenste luchtwegen voorkomen.


Abstract

Proteomics, een interface van snel evoluerende ontwikkelingen in de natuurkunde en biologie, ontwikkelt en breidt zijn potentiële toepassingen in moleculaire en cellulaire biologie snel uit. Toepassing van proteomics-tools heeft bijgedragen aan de identificatie van relevante eiwitbiomarkers die mogelijk de strategieën voor vroege diagnose en behandeling van verschillende ziekten kunnen veranderen. De opkomst van krachtige op massaspectrometrie gebaseerde proteomics-techniek heeft een nieuwe dimensie toegevoegd aan het veld van medisch onderzoek naar lever-, hartaandoeningen en bepaalde vormen van kanker. De meeste proteomics-tools worden ook gebruikt om fysiologische en pathologische gebeurtenissen met betrekking tot reproductieve biologie te bestuderen. Er zijn pogingen gedaan om de proteomen van teelballen, sperma, zaadvloeistof, epididymis, eicel en endometrium te genereren van patiënten met reproductieve ziekte. Hier hebben we de afgelopen tien jaar op proteomics gebaseerde onderzoeken bij mensen beoordeeld, die zich richten op het afbakenen van het mechanisme dat ten grondslag ligt aan verschillende reproductieve gebeurtenissen zoals spermatogenese, oogenese, endometriose, polycysteus ovariumsyndroom, embryo-ontwikkeling. De uitdaging is om nieuwe technologieën zoals 2-DE, DIGE, MALDI-MS, SELDI-MS, MUDPIT, LC-MS enz. in grotere mate te benutten om breed toepasbare klinische hulpmiddelen te ontwikkelen voor het begrijpen van moleculaire aspecten van reproductie, zowel in de ziekte.

Hoogtepunten

► Proteomics-onderzoeken op het gebied van reproductieve biologie ► Moleculair mechanisme betrokken bij fysiologische en pathologische omstandigheden in reproductieve weefsels/lichaamsvloeistoffen in normale en zieke toestand ► Nieuwere studies om onbeantwoorde vragen op te lossen die verband houden met pathologie van ziekte en ontdekking van biomarkers met behulp van proteomics-tools


ICMR JRF toelatingsexamen Indiase Raad voor Medisch Onderzoek (ICMR), NEW Delhi (Voor de toekenning van Junior Research Fellowship (JRF) in Life Science and Social Science van ICMR '8211 Indian Council of Medical Research, New Delhi)

De test bestaat uit één paper van 2 uur. Het papier zal uit 2 secties bestaan. De sectie Aptitude (sectie A) heeft 50 vragen over (1). Wetenschappelijk fenomeen in het dagelijks leven, (2). Algemene kennis in de wetenschappen, (3). Gemeenschappelijke statistieken.

Al deze vragen zouden verplicht zijn, waarbij elke vraag 1 cijfer zou hebben. Het onderwerp Specifieke Sectie (Sectie B & C) zou betrekking hebben op (B) Life Sciences en (C) Social Science. De kandidaat kan vragen stellen op een van de twee gebieden. Elk gebied van sectie B en C zou 100 vragen hebben en de kandidaat kan 75 vragen proberen in het vooraf ontworpen gebied van sectie B of C. Kandidaten moeten ook de optie voor sectie B of C in het aanvraagformulier aangeven. Elke vraag draagt ​​een cijfer. Negatieve markering @ 0.25 zal worden gemaakt voor elk van de verkeerde antwoorden. De vragen in beide secties verschijnen alleen in het Engels.

Het uiteindelijke resultaat is gebaseerd op een totaal van 55 % behaalde punten in zowel de secties voor de categorie Algemeen en OBC en 50% voor SC/ST en lichamelijk gehandicapten.

De toelatingstest van ICMR JRF wordt gehouden in de volgende stromen:

A. Proeve van bekwaamheid (gebruikelijk voor iedereen)

Onderwerpen die vallen onder de Life Sciences-stroom van ICMR JRF-toelatingsexamen:

Microbiologie, Fysiologie, Moleculaire Biologie, Genetica, Menselijke voeding, Menselijke Biologie, Biotechnologie, Biochemie, Biofysica, Immunologie, Farmacologie, Zoölogie, Milieuwetenschappen, Plantkunde, Diergeneeskunde, Bio-informatica.

SYLLABUS voor ICMR JRF toelatingsexamen: Life Sciences (*Voor ICMR JRF toelatingsexamen gebruiken ze de syllabus van CSIR UGC JRF NET Life Science Examination)

1. Moleculen en hun interactie relevant voor de biologie

4. Celcommunicatie en celsignalering

6. Systeemfysiologie – Plant

7. Systeemfysiologie – Dier

9. Diversiteit aan levensvormen

11. Evolutie en gedrag

1. MOLECULEN EN HUN INTERACTIE RELAVENT OP BIOLOGIE

Structuur van atomen, moleculen en chemische bindingen.

Samenstelling, structuur en functie van biomoleculen (koolhydraten, lipiden, eiwitten, nucleïnezuren en vitamines).

Stabiliserende interacties (Van der Waals, elektrostatisch, waterstofbinding, hydrofobe interactie, etc.).

Principes van biofysische chemie (pH, buffer, reactiekinetiek, thermodynamica, colligatieve eigenschappen).

Bio-energetica, glycolyse, oxidatieve fosforylering, gekoppelde reactie, groepsoverdracht, biologische energietransducers.

Principes van katalyse, enzymen en enzymkinetiek, enzymregulatie, mechanisme van enzymkatalyse, isozymen

Conformatie van eiwitten (Ramachandran-plot, secundaire structuur, domeinen, motief en plooien).

Conformatie van nucleïnezuren (helix (A, B, Z), t-RNA, micro-RNA).

Stabiliteit van eiwitten en nucleïnezuren.

Metabolisme van koolhydraten, lipiden, aminozuren, nucleotiden en vitamines.

2. CELLULAIRE ORGANISATIE

Membraanstructuur en functie: Structuur van modelmembraan, lipidedubbellaag en membraaneiwitdiffusie, osmose, ionenkanalen, actief transport, membraanpompen, mechanisme van sortering en regulatie van intracellulair transport, elektrische eigenschappen van membranen.

Structurele organisatie en functie van intracellulaire organellen: celwand, kern, mitochondriën, Golgi-lichamen, lysosomen, endoplasmatisch reticulum, peroxisomen, plastiden, vacuolen, chloroplast, structuur en functie van het cytoskelet en zijn rol in de beweeglijkheid.

Organisatie van genen en chromosomen: Operon, uniek en repetitief DNA, onderbroken genen, genfamilies, structuur van chromatine en chromosomen, heterochromatine, euchromatine, transposons.

Celdeling en celcyclus: mitose en meiose, hun regulering, stappen in de celcyclus, regulering en controle van de celcyclus.

Microbiële fysiologie: groeiopbrengst en kenmerken, strategieën van celdeling, stressrespons.

3. FUNDAMENTELE PROCESSEN

DNA-replicatie, reparatie en recombinatie: Eenheid van replicatie, betrokken enzymen, oorsprong van replicatie en replicatievork, betrouwbaarheid van replicatie, extrachromosomale replicons, DNA-beschadiging en reparatiemechanismen, homologe en plaatsspecifieke recombinatie.

RNA-synthese en -verwerking: transcriptiefactoren en -machines, vorming van initiatiecomplex, transcriptieactivator en -repressor, RNA-polymerasen, capping, verlenging en terminatie, RNA-verwerking, RNA-editing, splitsing en polyadenylatie, structuur en functie van verschillende soorten RNA, RNA-transport.

Eiwitsynthese en -verwerking: ribosoom, vorming van initiatiecomplex, initiatiefactoren en hun regulatie, verlenging en verlengingsfactoren, terminatie, genetische code, aminoacylatie van tRNA, tRNA-identiteit, aminoacyl-tRNA-synthetase en translationeel proeflezen, translationele remmers, Post - translationele modificatie van eiwitten.

Beheersing van genexpressie op transcriptie- en translatieniveau: regulering van de expressie van fagen, virussen, prokaryotische en eukaryote genen, rol van chromatine in genexpressie en genuitschakeling.

4. CELCOMMUNICATIE EN CELSIGNALERING

Interactie van gastheerparasieten Herkenning en ingangsprocessen van verschillende pathogenen zoals bacteriën, virussen in dierlijke en plantaardige gastheercellen, verandering van gastheercelgedrag door pathogenen, virusgeïnduceerde celtransformatie, pathogeengeïnduceerde ziekten bij dieren en planten, cel-celfusie in beide normale en abnormale cellen.

Celsignalering Hormonen en hun receptoren, celoppervlakreceptor, signalering via G-eiwit-gekoppelde receptoren, signaaltransductieroutes, tweede boodschappers, regulering van signaalroutes, bacteriële en plantaardige tweecomponentensystemen, lichtsignalering in planten, bacteriële chemotaxis en quorumdetectie.

Cellulaire communicatie Regulatie van hematopoëse, algemene principes van celcommunicatie, celadhesie en rollen van verschillende adhesiemoleculen, gap junctions, extracellulaire matrix, integrines, neurotransmissie en de regulatie ervan.

Kanker: Genetische herschikkingen in voorlopercellen, oncogenen, tumorsuppressorgenen, kanker en de celcyclus, virus-geïnduceerde kanker, metastase, interactie van kankercellen met normale cellen, apoptose, therapeutische interventies van ongecontroleerde celgroei.

Aangeboren en adaptief immuunsysteem Cellen en moleculen die betrokken zijn bij aangeboren en adaptieve immuniteit, antigenen, antigeniteit en immunogeniciteit. B- en T-celepitopen, structuur en functie van antilichaammoleculen. generatie van antilichaamdiversiteit, monoklonale antilichamen, antilichaamengineering, antigeen-antilichaam-interacties, MHC-moleculen, antigeenverwerking en presentatie, activering en differentiatie van B- en T-cellen, B- en T-celreceptoren, humorale en celgemedieerde immuunresponsen, primair en secundair immuunmodulatie, het complementsysteem, Toll-like receptoren, celgemedieerde effectorfuncties, ontsteking, overgevoeligheid en auto-immuniteit, immuunrespons tijdens bacteriële (tuberculose), parasitaire (malaria) en virale (hiv) infecties, aangeboren en verworven immunodeficiënties, vaccins.

5. ONTWIKKELINGSBIOLOGIE

Basisconcepten van ontwikkeling: Potentie, inzet, specificatie, inductie, competentie, bepaling en differentiatie morfogenetische gradiënten lot van cellen en cellijnen stamcellen genomische equivalentie en de cytoplasmatische determinanten die mutanten en transgenen inprenten bij analyse van ontwikkeling

Gametogenese, bevruchting en vroege ontwikkeling: productie van gameten, celoppervlakmoleculen in sperma-ei-herkenning bij dieren embryozakontwikkeling en dubbele bevruchting bij planten zygotevorming, splitsing, blastulavorming, embryonale velden, gastrulatie en vorming van kiemlagen bij dieren embryogenese, totstandbrenging van symmetrie in de zaadvorming en ontkieming van planten.

Morfogenese en organogenese bij dieren: celaggregatie en differentiatie in Dictyostelium-assen en patroonvorming in de organogenese van Drosophila, amfibieën en kippen - vulvavorming bij Caenorhabditis elegans, ooglensinductie, ledemaatontwikkeling en regeneratie bij gewervelde dieren differentiatie van neuronen, post-embryonale ontwikkeling - larvale vorming , metamorfose omgevingsregulatie van normale ontwikkeling geslachtsbepaling.

Morfogenese en organogenese in planten: organisatie van scheut en wortel apicaal meristeem scheut en wortelontwikkeling bladontwikkeling en phyllotaxie overgang naar bloei, bloemmeristemen en bloemontwikkeling in Arabidopsis en Antirrhinum

Geprogrammeerde celdood, veroudering en veroudering

6. SYSTEEM FYSIOLOGIE – PLANTAARDIG

Fotosynthese: Lichtoogstcomplexen mechanismen van elektronentransport fotoprotectieve mechanismen CO2-fixatie-C3-, C4- en CAM-routes.

Ademhaling en fotorespiratie: citroenzuurcyclus plant mitochondriaal elektronentransport en ATP-synthese alternatieve oxidase fotorespiratoire route.

Stikstofmetabolisme: nitraat- en ammoniumassimilatie-aminozuurbiosynthese.

Plantenhormonen: biosynthese, opslag, afbraak en transport fysiologische effecten en werkingsmechanismen.

Sensorische fotobiologie: structuur, functie en werkingsmechanismen van fytochromen, cryptochromen en fototropines stomatale beweging fotoperiodisme en biologische klokken.

Transport van opgeloste stoffen en fotoassimilatietranslocatie: opname, transport en translocatie van water, ionen, opgeloste stoffen en macromoleculen uit de bodem, door cellen, door membranen, door xyleem- en floëemtranspiratiemechanismen voor het laden en lossen van foto-assimilaten.

Secundaire metabolieten: biosynthese van terpenen, fenolen en stikstofverbindingen en hun rol.

Stressfysiologie: reacties van planten op biotische (ziekteverwekker en insecten) en abiotische (water, temperatuur en zout) stress.

7. SYSTEEM FYSIOLOGIE – DIEREN

Bloed en bloedsomloop: Bloedlichaampjes, hemopoëse en gevormde elementen, plasmafunctie, bloedvolume, bloedvolumeregulatie, bloedgroepen, hemoglobine, immuniteit, hemostase.

Cardiovasculair systeem: vergelijkende anatomie van de hartstructuur, myogeen hart, gespecialiseerd weefsel, ECG – het principe en de betekenis ervan, hartcyclus, hart als pomp, bloeddruk, neurale en chemische regulatie van al het bovenstaande.

Ademhalingssysteem: vergelijking van de ademhaling bij verschillende soorten, anatomische overwegingen, transport van gassen, uitwisseling van gassen, afvalverwijdering, neurale en chemische regulatie van de ademhaling.

Zenuwstelsel: neuronen, actiepotentiaal, grove neuroanatomie van de hersenen en het ruggenmerg, centraal en perifeer zenuwstelsel, neurale controle van spiertonus en houding.

Zintuigen: zicht, gehoor en tactiele respons.

Excretiesysteem: Vergelijkende fysiologie van uitscheiding, nier, urinevorming, urineconcentratie, afvalverwijdering, mictie, regulering van de waterhuishouding, bloedvolume, bloeddruk, elektrolytenhuishouding, zuur-base-evenwicht.

Thermoregulatie: comfortzone, lichaamstemperatuur - fysiek, chemisch, neurale regulatie, acclimatisatie.

Spijsverteringsstelsel – Spijsvertering, opname, energiebalans, BMR.

Endocrinologie en reproductie: Endocriene klieren, basismechanisme van hormoonwerking, hormonen en ziekten reproductieve processen, gametogenese, ovulatie, neuro-endocriene regulatie

8. ERFENIS BIOLOGIE

Mendeliaanse principes: dominantie, segregatie, onafhankelijk assortiment.

Concept van gen: allel, meerdere allelen, pseudo-allel, complementatietests

Uitbreidingen van Mendeliaanse principes: co-dominantie, onvolledige dominantie, geninteracties, pleiotropie, genomische imprinting, penetrantie en expressiviteit, fenokopie, koppeling en kruising, geslachtskoppeling, geslachtsbeperkte en geslachtsbeïnvloede karakters.

Methoden voor het in kaart brengen van genen: koppelingskaarten, tetrad-analyse, kartering met moleculaire merkers, kartering met behulp van somatische celhybriden, ontwikkeling van karteringspopulatie in planten.

Extra chromosomale overerving: Overerving van mitochondriale en chloroplastgenen, maternale overerving.

Microbiële genetica: methoden voor genetische overdracht - transformatie, conjugatie, transductie en geslachtsductie, genen in kaart brengen door onderbroken paring, fijne structuuranalyse van genen.

Menselijke genetica: stamboomanalyse, lod-score voor koppelingstesten, karyotypes, genetische aandoeningen.

Kwantitatieve genetica: polygene overerving, erfelijkheid en zijn metingen, QTL-mapping.

Mutatie: typen, oorzaken en detectie, mutanttypen - dodelijk, voorwaardelijk, biochemisch, functieverlies, functiewinst, germinale verzen somatische mutanten, insertiemutagenese.

Structurele en numerieke veranderingen van chromosomen: deletie, duplicatie, inversie, translocatie, ploïdie en hun genetische implicaties.

Recombinatie: Homologe en niet-homologe recombinatie inclusief transpositie.

9. DIVERSITEIT VAN LEVENSVORMEN

Principes en methoden van taxonomie: concepten van soorten en hiërarchische taxa, biologische nomenclatuur, klassieke en kwantitatieve methoden van taxonomie van planten, dieren en micro-organismen.

Niveaus van structurele organisatie: eencellige, koloniale en meercellige vormen. Niveaus van organisatie van weefsels, organen en systemen. Vergelijkende anatomie, adaptieve straling, adaptieve modificaties.

Overzichtsclassificatie van planten, dieren en micro-organismen: Belangrijke criteria die worden gebruikt voor classificatie in elk taxon. Classificatie van planten, dieren en micro-organismen. Evolutionaire relaties tussen taxa.

Natuurlijke geschiedenis van het Indiase subcontinent: belangrijke habitattypen van het subcontinent, geografische oorsprong en migraties van soorten. Gemeenschappelijke Indiase zoogdieren, vogels. Seizoensgebondenheid en fenologie van het subcontinent.

Organismen van gezondheid & agrarisch belang: Veel voorkomende parasieten en ziekteverwekkers van mensen, huisdieren en gewassen.

Organismen van zorg voor instandhouding: Zeldzame, bedreigde soorten. Behoud strategieën.

10. ECOLOGISCHE PRINCIPES

De omgeving: fysieke omgeving biotische omgeving biotische en abiotische interacties.

Habitat en niche: concept van habitat- en niche-nichebreedte en overlappen fundamentele en gerealiseerde karakterverplaatsing van nichebronnen.

Populatie-ecologie: kenmerken van een populatie Populatiegroeicurves populatieregulatie levensgeschiedenisstrategieën (r en K-selectie) concept van metapopulatie - demes en verspreiding, interdemische uitstervingen, leeftijdsgestructureerde populaties.

Soorten interacties: Soorten interacties, interspecifieke competitie, herbivoren, carnivoor, bestuiving, symbiose.

Gemeenschapsecologie: Aard van gemeenschappen, gemeenschapsstructuur en kenmerken van soortendiversiteit en de meetranden en ecotonen.

Ecologische successie: Types mechanismen veranderingen die betrokken zijn bij successieconcept van climax.

Ecosysteemecologie: Ecosysteemstructuur ecosysteemfunctie energiestroom en minerale kringloop (C,N,P) primaire productie en afbraak structuur en functie van enkele Indiase ecosystemen: terrestrische (bos, grasland) en aquatische (zoet water, zee, estuariene).

Biogeografie: Major terrestrische biomen theorie van eiland biogeografie biogeografische zones van India.

Toegepaste ecologie: milieuvervuiling globale milieuverandering biodiversiteit: status, monitoring en documentatie belangrijke aanjagers van biodiversiteitsverandering benaderingen van biodiversiteitsbeheer.

Conservation Biology: Principes van instandhouding, belangrijke benaderingen van beheer, Indiase casestudies over instandhouding/beheerstrategie (Project Tiger, Biosphere Reserves)

11. EVOLUTIE EN GEDRAG

Opkomst van evolutionaire gedachten: Lamarck Darwin-concepten van variatie, aanpassing, strijd, fitness en natuurlijke selectie Mendelisme Spontaniteit van mutaties de evolutionaire synthese.

Oorsprong van cellen en eencellige evolutie: Oorsprong van biologische basismoleculen Abiotische synthese van organische monomeren en polymeren Concept van Oparin en Haldane Experiment van Miller (1953) De eerste cel Evolutie van prokaryoten Oorsprong van eukaryote cellen Evolutie van eencellige eukaryoten Anaëroob metabolisme, fotosynthese en aerobe metabolisme.

Paleontologie en evolutionaire geschiedenis: de evolutionaire tijdschaal Tijdperken, perioden en tijdperken Belangrijke gebeurtenissen in de evolutionaire tijdschaal Oorsprong van eencellige en meercellige organismen Grote groepen planten en dieren Stadia in de evolutie van primaten, waaronder Homo.

Moleculaire evolutie: concepten van neutrale evolutie, moleculaire divergentie en moleculaire klokken Moleculaire hulpmiddelen in fylogenie, classificatie en identificatie Eiwit- en nucleotidesequentieanalyse oorsprong van nieuwe genen en eiwitten Genduplicatie en divergentie.

De mechanismen: populatiegenetica - populaties, genenpool, genfrequentie Hardy-Weinberg Wetsconcepten en snelheid van verandering in genfrequentie door natuurlijke selectie, migratie en willekeurige genetische drift Adaptieve straling Isolerende mechanismen Soortvorming Allopatricity en Sympatricity Convergente evolutie Seksuele selectie Co-evolutie.

Hersenen, gedrag en evolutie: benaderingen en methoden in de studie van gedrag Nabije en uiteindelijke oorzaak Altruïsme en evolutie-Groepsselectie, Kin-selectie, Wederzijds altruïsme Neurale basis van leren, geheugen, cognitie, slaap en opwinding Biologische klokken Ontwikkeling van gedrag Sociale communicatie Sociale dominantie Gebruik van ruimte en territorialiteit Paringsystemen, ouderinvestering en reproductief succes Ouderzorg Agressief gedrag Habitatselectie en optimalisatie bij foerageren Migratie, oriëntatie en navigatie Domesticatie en gedragsveranderingen.

12. TOEGEPASTE BIOLOGIE:

Microbiële fermentatie en productie van kleine en macromoleculen.

Toepassing van immunologische principes, vaccins, diagnostiek. Weefsel- en celkweekmethoden voor planten en dieren.

Transgene dieren en planten, moleculaire benaderingen voor diagnose en identificatie van stammen.

Genomics en de toepassing ervan op gezondheid en landbouw, inclusief gentherapie.

Biobron en gebruik van biodiversiteit.

Veredeling bij planten en dieren, inclusief marker – geassisteerde selectie

Bioremediatie en fytoremediatie

13. METHODEN IN DE BIOLOGIE

Moleculaire biologie en recombinant-DNA-methoden: Isolatie en zuivering van RNA, DNA (genomisch en plasmide) en eiwitten, verschillende scheidingsmethoden. Analyse van RNA, DNA en eiwitten door een- en tweedimensionale gelelektroforese, iso-elektrische focusserende gels. Moleculaire klonering van DNA- of RNA-fragmenten in bacteriële en eukaryote systemen. Expressie van recombinante eiwitten met behulp van bacteriële, dierlijke en plantaardige vectoren. Isolatie van specifieke nucleïnezuursequenties Generatie van genomische en cDNA-bibliotheken in plasmide-, faag-, cosmide-, BAC- en YAC-vectoren. In vitro mutagenese en deletietechnieken, gen knock-out in bacteriële en eukaryote organismen. Eiwitsequencing-methoden, detectie van post-translatiemodificatie van eiwitten. DNA-sequencingmethoden, strategieën voor genoomsequencing. Methoden voor analyse van genexpressie op RNA- en eiwitniveau, grootschalige expressie, zoals op microarray gebaseerde technieken Isolatie, scheiding en analyse van koolhydraat- en lipidemoleculen RFLP-, RAPD- en AFLP-technieken

Histochemische en immunotechnieken: antilichaamgeneratie, detectie van moleculen met behulp van ELISA, RIA, western blot, immunoprecipitatie, fluocytometrie en immunofluorescentiemicroscopie, detectie van moleculen in levende cellen, in situ lokalisatie door technieken zoals FISH en GISH.

Biofysische methode: Moleculaire analyse met behulp van UV/zichtbaar, fluorescentie, circulair dichroïsme, NMR- en ESR-spectroscopie Moleculaire structuurbepaling met behulp van röntgendiffractie en NMR, Moleculaire analyse met behulp van lichtverstrooiing, verschillende soorten massaspectrometrie en oppervlakteplasmaresonantiemethoden.

Statistische methoden: metingen van centrale tendens en spreiding van waarschijnlijkheidsverdelingen (binomiaal, poisson en normaal) Steekproefverdeling Verschil tussen parametrische en niet-parametrische statistieken Betrouwbaarheidsinterval Fouten Niveaus van significantie Regressie- en correlatie-t-test Variantieanalyse X2-test Basisinleiding tot muetrovariate-statistieken , enzovoort.

Radiolabelingtechnieken: detectie en meting van verschillende soorten radio-isotopen die normaal in de biologie worden gebruikt, incorporatie van radio-isotopen in biologische weefsels en cellen, moleculaire beeldvorming van radioactief materiaal, veiligheidsrichtlijnen.

Microscopic techniques: Visualization of cells and subcellular components by light microscopy, resolving powers of different microscopes, microscopy of living cells, scanning and transmission microscopes, different fixation and staining techniques for EM, freeze-etch and freeze- fracture methods for EM, image processing methods in microscopy.

Electrophysiological methods: Single neuron recording, patch-clamp recording, ECG, Brain activity recording, lesion and stimulation of brain, pharmacological testing, PET, MRI, fMRI, CAT.

Methods in field biology: Methods of estimating population density of animals and plants, ranging patterns through direct, indirect and remote observations, sampling methods in the study of behavior, habitat characterization: ground and remote sensing methods.

*For ICMR JRF Entrance Examination, they use the Syllabus of CSIR UGC JRF NET Life Science Examination


Referenties

Varki, A. Biological roles of oligosaccharides: all of the theories are correct. Glycobiologie 3, 97–130 (1993).

Haltiwanger, R. S. & Lowe, J. B. Role of glycosylation in development. Ann. ds. Biochem. 73, 491–537 (2004).

Dennis, J. W., Lau, K. S., Demetriou, M. & Nabi, I. R. Adaptive regulation at the cell surface by N-glycosylation. Traffic 10, 1569–1578 (2009).

Hoseki, J., Ushioda, R. & Nagata, K. Mechanism and components of endoplasmic reticulum-associated degradation. J. Biochem. 147, 19–25 (2010).

Kollmann, K. et al. Mannose phosphorylation in health and disease. EUR. J. Cell Biol. 89, 117–123 (2010).

Hart, G. W., Slawson, C., Ramirez-Correa, G. & Lagerlof, O. Cross talk between O-GlcNAcylation and phosphorylation: roles in signaling, transcription, and chronic disease. Ann. ds. Biochem. 80, 825–858 (2011).

Cummings, R. D. The repertoire of glycan determinants in the human glycome. Mol. Biosyst. 5, 1087–1104 (2009).

Rothman, J. E. & Fine, R. E. Coated vesicles transport newly synthesized membrane glycoproteins from endoplasmic reticulum to plasma membrane in two successive stages. Proc. Natl Acad. Wetenschap. VS 77, 780–784 (1980).

Roth, J. Protein N-glycosylation along the secretory pathway: relationship to organelle topography and function, protein quality control, and cell interactions. Chem. ds. 102, 285–303 (2002).

Peanne, R. et al. Differential effects of lobe A and lobe B of the Conserved Oligomeric Golgi complex on the stability of β1,4-galactosyltransferase 1 and α2,6-sialyltransferase 1. Glycobiologie 21, 864–876 (2011).

Nairn, A. V. & Moremen, K. W. in Handbook of Glycomics (eds Cummings, R. & Pierce, J.M.) 95–136 (Academic Press, 2009).

Nairn, A. V. et al. Regulation of glycan structures in animal tissues: transcript profiling of glycan-related genes. J. Biol. Chem. 283, 17298–17313 (2008). Presents transcript analysis paired with glycan structural data to identify correlations between glycan-related gene expression and glycan composition in mouse tissues.

Spiro, R. G. Protein glycosylation: nature, distribution, enzymatic formation, and disease implications of glycopeptide bonds. Glycobiologie 12, 43R–56R (2002).

Schachter, H. The joys of HexNAc. The synthesis and function of N- and O-glycan branches. Glycoconj. J. 17, 465–483 (2000).

Schachter, H. The 'yellow brick road' to branched complex N-glycans. Glycobiologie 1, 453–461 (1991).

Zaia, J. Mass spectrometry and glycomics. Omics: J. Integrative Biol. 14, 401–418 (2010).

Apweiler, R., Hermjakob, H. & Sharon, N. On the frequency of protein glycosylation, as deduced from analysis of the SWISS-PROT database. Biochim. Biofysica. Acta 1473, 4–8 (1999).

Kornfeld, R. & Kornfeld, S. Assembly of asparagine-linked oligosaccharides. Ann. ds. Biochem. 54, 631–664 (1985).

Lizak, C., Gerber, S., Numao, S., Aebi, M. & Locher, K. P. X-ray structure of a bacterial oligosaccharyltransferase. Natuur 474, 350–355 (2011). Reports the first structure of an OST in complex with a peptide substrate and describes a proposed mechanism that is likely to extend to the eukaryotic enzyme.

Kelleher, D. J. & Gilmore, R. An evolving view of the eukaryotic oligosaccharyltransferase. Glycobiologie 16, 47R–62R (2006).

Zielinska, D. F., Gnad, F., Wisniewski, J. R. & Mann, M. Precision mapping of an in vivo N-glycoproteome reveals rigid topological and sequence constraints. Cel 141, 897–907 (2010). Describes the use of lectin-affinity enrichment of glycopeptides followed by proteomics analysis to identify 6,367 mouse glycosylation sites, including several classes of novel acceptor sequons.

Schreiner, R., Schnabel, E. & Wieland, F. Novel N-glycosylation in eukaryotes: laminin contains the linkage unit β-glucosylasparagine. J. Cell Biol. 124, 1071–1081 (1994).

Valliere-Douglass, J. F. et al. Glutamine-linked and non-consensus asparagine-linked oligosaccharides present in human recombinant antibodies define novel protein glycosylation motifs. J. Biol. Chem. 285, 16012–16022 (2010).

Kelleher, D. J., Karaoglu, D., Mandon, E. C. & Gilmore, R. Oligosaccharyltransferase isoforms that contain different catalytic STT3 subunits have distinct enzymatic properties. Mol. Cel 12, 101–111 (2003).

Imperiali, B. & Hendrickson, T. L. Asparagine-linked glycosylation: specificity and function of oligosaccharyl transferase. Bioorg. Med. Chem. 3, 1565–1578 (1995).

Larkin, A. & Imperiali, B. The expanding horizons of asparagine-linked glycosylation. Biochemie 50, 4411–4426 (2011).

Schwarz, F. & Aebi, M. Mechanisms and principles of N-linked protein glycosylation. Curr. Opin. structuur. Biol. 21, 576–582 (2011).

Weerapana, E. & Imperiali, B. Asparagine-linked protein glycosylation: from eukaryotic to prokaryotic systems. Glycobiologie 16, 91R–101R (2006).

Mohorko, E., Glockshuber, R. & Aebi, M. Oligosaccharyltransferase: the central enzyme of N-linked protein glycosylation. J. Erven. Metab. Dis. 34, 869–878 (2011).

Helenius, A. & Aebi, M. Roles of N-linked glycans in the endoplasmic reticulum. Ann. ds. Biochem. 73, 1019–1049 (2004).

Lederkremer, G. Z. Glycoprotein folding, quality control and ER-associated degradation. Curr. Opin. structuur. Biol. 19, 515–523 (2009).

D'Alessio, C., Caramelo, J. J. & Parodi, A. J. UDP-GlC:glycoprotein glucosyltransferase-glucosidase II, the ying-yang of the ER quality control. Semin. Cell Dev. Biol. 21, 491–499 (2010).

Clerc, S. et al. Htm1 protein generates the N-glycan signal for glycoprotein degradation in the endoplasmic reticulum. J. Cell Biol. 184, 159–172 (2009).

Gauss, R., Kanehara, K., Carvalho, P., Ng, D. T. & Aebi, M. A complex of pdi1p and the mannosidase htm1p initiates clearance of unfolded glycoproteins from the endoplasmic reticulum. Mol. Cel 42, 782–793 (2011).

Mast, S. W. & Moremen, K. W. Family 47 α-mannosidases in N-glycan processing. Methoden Enzymol. 415, 31–46 (2006).

Moremen, K. W. & Molinari, M. N-linked glycan recognition and processing: the molecular basis of endoplasmic reticulum quality control. Curr. Opin. structuur. Biol. 16, 592–599 (2006).

Aebi, M., Bernasconi, R., Clerc, S. & Molinari, M. N-glycan structures: recognition and processing in the ER. TrendsBiochem. Wetenschap. 35, 74–82 (2010).

Xie, W., Kanehara, K., Sayeed, A. & Ng, D. T. Intrinsic conformational determinants signal protein misfolding to the Hrd1/Htm1 endoplasmic reticulum-associated degradation system. Mol. Biol. Cel 20, 3317–3329 (2009). Describes the roles of key N -linked glycan sites that mark structural determinants that are sensitive to the overall folding state of the molecule and mediate targeting of misfolded proteins for ER-associated degradation.

Kanehara, K., Xie, W. & Ng, D. T. Modularity of the Hrd1 ERAD complex underlies its diverse client range. J. Cell Biol. 188, 707–716 (2010).

An, H. J. et al. Extensive determination of glycan heterogeneity reveals an unusual abundance of high mannose glycans in enriched plasma membranes of human embryonic stem cells. Mol. Cel. Proteomics 11, M111.010660 (2012).

Rabouille, C. et al. Mapping the distribution of Golgi enzymes involved in the construction of complex oligosaccharides. J. Cel Wetenschap. 108, 1617–1627 (1995).

Stanley, P. Golgi glycosylation. Koude Lente Harb. Perspectief. Biol. 3, a005199 (2011).

Mogelsvang, S., Marsh, B. J., Ladinsky, M. S. & Howell, K. E. Predicting function from structure: 3D structure studies of the mammalian Golgi complex. Traffic 5, 338–345 (2004).

Papanikou, E. & Glick, B. S. The yeast Golgi apparatus: insights and mysteries. FEBS Lett. 583, 3746–3751 (2009).

Ripoche, J., Link, B., Yucel, J. K., Tokuyasu, K. & Malhotra, V. Location of Golgi membranes with reference to dividing nuclei in syncytial Drosophila embryos. Proc. Natl Acad. Wetenschap. VS 91, 1878–1882 (1994).

Velasco, A. et al. Cell type-dependent variations in the subcellular distribution of α-mannosidase I and II. J. Cell Biol. 122, 39–51 (1993).

Nilsson, T. et al. Overlapping distribution of two glycosyltransferases in the Golgi apparatus of HeLa cells. J. Cell Biol. 120, 5–13 (1993).

Chou, C. F. & Omary, M. B. Mitotic arrest with anti-microtubule agents or okadaic acid is associated with increased glycoprotein terminal GlcNAc's. J. Cel Wetenschap. 107, 1833–1843 (1994).

Haltiwanger, R. S. & Philipsberg, G. A. Mitotic arrest with nocodazole induces selective changes in the level of O-gekoppeld N-acetylglucosamine and accumulation of incompletely processed N-glycans on proteins from HT29 cells. J. Biol. Chem. 272, 8752–8758 (1997).

Klausner, R. D., Donaldson, J. G. & Lippincott-Schwartz, J. Brefeldin A: insights into the control of membrane traffic and organelle structure. J. Cell Biol. 116, 1071–1080 (1992).

Peyroche, A. et al. Brefeldin A acts to stabilize an abortive ARF-GDP-Sec7 domain protein complex: involvement of specific residues of the Sec7 domain. Mol. Cel 3, 275–285 (1999).

Rogalski, A. A., Bergmann, J. E. & Singer, S. J. Effect of microtubule assembly status on the intracellular processing and surface expression of an integral protein of the plasma membrane. J. Cell Biol. 99, 1101–1109 (1984).

Sampath, D., Varki, A. & Freeze, H. H. The spectrum of incomplete N-linked oligosaccharides synthesized by endothelial cells in the presence of brefeldin A. J. Biol. Chem. 267, 4440–4455 (1992).

Balch, W. E., Dunphy, W. G., Braell, W. A. & Rothman, J. E. Reconstitution of the transport of protein between successive compartments of the Golgi measured by the coupled incorporation of N-acetylglucosamine. Cel 39, 405–416 (1984).

Glick, B. S. & Luini, A. Models for Golgi traffic: a critical assessment. Koude Lente Harb. Perspectief. Biol. 3, a005215 (2011).

Goud, B. & Gleeson, P. A. TGN golgins, Rabs and cytoskeleton: regulating the Golgi trafficking highways. Trends Cell Biol. 20, 329–336 (2010).

Jackson, C. L. Mechanisms of transport through the Golgi complex. J. Cel Wetenschap. 122, 443–452 (2009).

Jamieson, J. D. & Palade, G. E. Intracellular transport of secretory proteins in the pancreatic exocrine cell. 3. Dissociation of intracellular transport from protein synthesis. J. Cell Biol. 39, 580–588 (1968).

Kartberg, F., Elsner, M., Froderberg, L., Asp, L. & Nilsson, T. Commuting between Golgi cisternae--mind the GAP! Biochim. Biofysica. Acta 1744, 351–363 (2005).

Marchi, F. & Leblond, C. P. Radioautographic characterization of successive compartments along the rough endoplasmic reticulum-Golgi pathway of collagen precursors in foot pad fibroblasts of [3H]proline-injected rats. J. Cell Biol. 98, 1705–1709 (1984).

Reynders, E., Foulquier, F., Annaert, W. & Matthijs, G. How Golgi glycosylation meets and needs trafficking: the case of the COG complex. Glycobiologie 21, 853–863 (2011).

Munro, S. An investigation of the role of transmembrane domains in Golgi protein retention. EMBO J. 14, 4695–4704 (1995).

Patterson, G. H. et al. Transport through the Golgi apparatus by rapid partitioning within a two-phase membrane system. Cel 133, 1055–1067 (2008). Proposes a model for Golgi trafficking in which cargo proteins are not carried through the Golgi as if on a conveyer belt. Rather, cargo proteins partition into processing or transport domains that possess distinctive lipid compositions.

Sharpe, H. J., Stevens, T. J. & Munro, S. A comprehensive comparison of transmembrane domains reveals organelle-specific properties. Cel 142, 158–169 (2010). A tour-de-force bioinformatic analysis of the physico-chemical properties of transmembrane domains of organellar proteins from fungi to vertebrates, demonstrating a conserved dichotomy in transmembrane domain properties that distinguish early from late secretory compartments.

Schmitz, K. R. et al. Golgi localization of glycosyltransferases requires a Vps74p oligomer. ontwikkelaar Cel 14, 523–534 (2008).

Tu, L., Tai, W. C., Chen, L. & Banfield, D. K. Signal-mediated dynamic retention of glycosyltransferases in the Golgi. Wetenschap 321, 404–407 (2008).

Aoki, D., Lee, N., Yamaguchi, N., Dubois, C. & Fukuda, M. N. Golgi retention of a trans-Golgi membrane protein, galactosyltransferase, requires cysteine and histidine residues within the membrane-anchoring domain. Proc. Natl Acad. Wetenschap. VS 89, 4319–4323 (1992).

Colley, K. J. Golgi localization of glycosyltransferases: more questions than answers. Glycobiologie 7, 1–13 (1997).

Colley, K. J., Lee, E. U. & Paulson, J. C. The signal anchor and stem regions of the β-galactoside α2,6-sialyltransferase may each act to localize the enzyme to the Golgi apparatus. J. Biol. Chem. 267, 7784–7793 (1992).

Fenteany, F. H. & Colley, K. J. Multiple signals are required for α2,6-sialyltransferase (ST6Gal I) oligomerization and Golgi localization. J. Biol. Chem. 280, 5423–5429 (2005).

Nilsson, T., Lucocq, J. M., Mackay, D. & Warren, G. The membrane spanning domain of β-1,4-galactosyltransferase specifies trans Golgi localization. EMBO J. 10, 3567–3575 (1991).

Nilsson, T., Rabouille, C., Hui, N., Watson, R. & Warren, G. The role of the membrane-spanning domain and stalk region of N-acetylglucosaminyltransferase I in retention, kin recognition and structural maintenance of the Golgi apparatus in HeLa cells. J. Cel Wetenschap. 109, 1975–1989 (1996).

Banfield, D. K. Mechanisms of protein retention in the Golgi. Koude Lente Harb. Perspectief. Biol. 3, a005264 (2011).

Tu, L. & Banfield, D. K. Localization of Golgi-resident glycosyltransferases. Cel. Mol. Levenswetenschap. 67, 29–41 (2010).

Nilsson, T., Slusarewicz, P., Hoe, M. H. & Warren, G. Kin recognition. A model for the retention of Golgi enzymes. FEBS Lett. 330, 1–4 (1993).

Hassinen, A., Rivinoja, A., Kauppila, A. & Kellokumpu, S. Golgi N-glycosyltransferases form both homo- and heterodimeric enzyme complexes in live cells. J. Biol. Chem. 285, 17771–17777 (2010). Bimolecular fluorescence complementation reveals that key glycosyltransferases form homocomplexes, but also form distinct heterocomplexes with functionally related glycosyltransferases that are localized to either medial or trans -Golgi compartments.

Daniotti, J. L., Martina, J. A., Giraudo, C. G., Zurita, A. R. & Maccioni, H. J. GM3 α2,8-sialyltransferase (GD3 synthase): protein characterization and sub-golgi location in CHO-K1 cells. J. Neurochem. 74, 1711–1720 (2000).

Giraudo, C. G. & Maccioni, H. J. Ganglioside glycosyltransferases organize in distinct multienzyme complexes in CHO-K1 cells. J. Biol. Chem. 278, 40262–40271 (2003).

Yano, H. et al. Distinct functional units of the Golgi complex in Drosophila cellen. Proc. Natl Acad. Wetenschap. VS 102, 13467–13472 (2005).

Freeze, H. H. Congenital disorders of glycosylation: CDG-I, CDG-II, and beyond. Curr. Mol. Med. 7, 389–396 (2007).

Foulquier, F. COG defects, birth and rise! Biochim. Biofysica. Acta 1792, 896–902 (2009).

Pokrovskaya, I. D. et al. Conserved oligomeric Golgi complex specifically regulates the maintenance of Golgi glycosylation machinery. Glycobiologie 21, 1554–1569 (2011).

Smith, R. D. & Lupashin, V. V. Role of the conserved oligomeric Golgi (COG) complex in protein glycosylation. Carbohydr. Onderzoek 343, 2024–2031 (2008).

Wu, X. et al. Mutation of the COG complex subunit gene COG7 causes a lethal congenital disorder. Nature Med. 10, 518–523 (2004). First demonstration of a human disorder associated with altered Golgi transport. Patient fibroblasts were shown to be deficient in intra-Golgi transport.

Oka, T., Ungar, D., Hughson, F. M. & Krieger, M. The COG and COPI complexes interact to control the abundance of GEARs, a subset of Golgi integral membrane proteins. Mol. Biol. Cel 15, 2423–2435 (2004).

Gill, D. J., Chia, J., Senewiratne, J. & Bard, F. Regulation of O-glycosylation through Golgi-to-ER relocation of initiation enzymes. J. Cell Biol. 189, 843–858 (2010). SRC-dependent growth factor stimulation drives the relocation of polypeptide GalNAc transferases to earlier secretory compartments, enhancing the production of GalNAc initiated O -linked glycans.

Baas, S. et al. Sugar-free frosting, a homolog of SAD kinase, drives neural-specific glycan expression in the Drosophila embryo. Ontwikkeling 138, 553–563 (2011). A partial loss-of-function mutation in a neural specific kinase decreases expression of a set of neural-specific glycans, demonstrating a direct link between protein phosphorylation, Golgi architecture and glycan end-products.

Farhan, H. et al. MAPK signaling to the early secretory pathway revealed by kinase/phosphatase functional screening. J. Cell Biol. 189, 997–1011 (2010). An RNA interference screen for kinases and phosphatases that alter ER and Golgi trafficking identified 122 such proteins, indicating a broad role for cell signaling in sculpting flux through the secretory pathway with subsequent, but not yet demonstrated, glycomic consequences.

Lowe, M. et al. Cdc2 kinase directly phosphorylates the cis-Golgi matrix protein GM130 and is required for Golgi fragmentation in mitosis. Cel 94, 783–793 (1998).

Muniz, M., Alonso, M., Hidalgo, J. & Velasco, A. A regulatory role for cAMP-dependent protein kinase in protein traffic along the exocytic route. J. Biol. Chem. 271, 30935–30941 (1996).

Colley, K. J. Structural basis for the polysialylation of the neural cell adhesion molecule. Adv. Exp. Med. Biol. 663, 111–126 (2010).

Rana, N. A. & Haltiwanger, R. S. Fringe benefits: functional and structural impacts of O-glycosylation on the extracellular domain of Notch receptors. Curr. Opin. structuur. Biol. 21, 583–589 (2011).

Hanisch, F. G. & Breloy, I. Protein-specific glycosylation: signal patches and cis-controlling peptidic elements. Biol. Chem. 390, 619–626 (2009).

Luther, K. B. & Haltiwanger, R. S. Role of unusual O-glycans in intercellular signaling. Int. J. Biochem. Cel Biol. 41, 1011–1024 (2009).

Muntoni, F., Torelli, S., Wells, D. J. & Brown, S. C. Muscular dystrophies due to glycosylation defects: diagnosis and therapeutic strategies. Curr. Opin. neurol. 24, 437–442 (2011).

Stanley, P. & Okajima, T. Roles of glycosylation in Notch signaling. Curr. Bovenkant. ontwikkelaar Biol. 92, 131–164 (2010).

Wopereis, S., Lefeber, D. J., Morava, E. & Wevers, R. A. Mechanisms in protein O-glycan biosynthesis and clinical and molecular aspects of protein O-glycan biosynthesis defects: a review. clin. Chem. 52, 574–600 (2006).

Sakaidani, Y. et al. O-linked-N-acetylglucosamine modification of mammalian Notch receptors by an atypical O-GlcNAc transferase Eogt1. Biochem. Biofysica. Onderzoek gemeenschappelijk 419, 14–19 (2012). The authors identifyied a unique O -GlcNAc transferase, EOGT, involved in the O -GlcNAcylation of extracellular proteins.

Shao, L., Moloney, D. J. & Haltiwanger, R. Fringe modifies O-fucose on mouse Notch1 at epidermal growth factor-like repeats within the ligand-binding site and the Abruptex region. J. Biol. Chem. 278, 7775–7782 (2003).

Wang, Y. et al. Modification of epidermal growth factor-like repeats with O-fucose. Molecular cloning and expression of a novel GDP-fucose protein O-fucosyltransferase. J. Biol. Chem. 276, 40338–40345 (2001).

Okajima, T. & Irvine, K. D. Regulation of Notch signaling by O-linked fucose. Cel 111, 893–904 (2002).

Shi, S. & Stanley, P. Protein O-fucosyltransferase 1 is an essential component of Notch signaling pathways. Proc. Natl Acad. Wetenschap. VS 100, 5234–5239 (2003).

Yao, D. et al. Eiwit O-fucosyltransferase 1 (Pofut1) regulates lymphoid and myeloid homeostasis through modulation of Notch receptor ligand interactions. Bloed 117, 5652–5662 (2011).

Acar, M. et al. Rumi is a CAP10 domain glycosyltransferase that modifies Notch and is required for Notch signaling. Cel 132, 247–258 (2008).

Sethi, M. K. et al. Identification of glycosyltransferase 8 family members as xylosyltransferases acting on O-glucosylated notch epidermal growth factor repeats. J. Biol. Chem. 285, 1582–1586 (2010).

Sethi, M. K. et al. Molecular cloning of a xylosyltransferase that transfers the second xylose to O-glucosylated epidermal growth factor repeats of notch. J. Biol. Chem. 287, 2739–2748 (2012).

Rana, N. A. et al. O-Glucose trisaccharide is present at high but variable stoichiometry at multiple sites on mouse Notch1. J. Biol. Chem. 286, 31623–31637 (2011).

Fernandez-Valdivia, R. et al. Regulation of mammalian Notch signaling and embryonic development by the protein O-glucosyltransferase Rumi. Ontwikkeling 138, 1925–1934 (2011).

Sakaidani, Y. et al. O-linked-N-acetylglucosamine on extracellular protein domains mediates epithelial cell-matrix interactions. Nature Commun. 2, 583 (2011).

Matsuura, A. et al. O-gekoppeld N-acetylglucosamine is present on the extracellular domain of notch receptors. J. Biol. Chem. 283, 35486–35495 (2008).

Hofsteenge, J. et al. C-mannosylation and O-fucosylation of the thrombospondin type 1 module. J. Biol. Chem. 276, 6485–6498 (2001).

Luo, Y., Koles, K., Vorndam, W., Haltiwanger, R. S. & Panin, V. M. Protein O-fucosyltransferase 2 adds O-fucose to thrombospondin type 1 repeats. J. Biol. Chem. 281, 9393–9399 (2006).

Martinez-Duncker, I., Mollicone, R., Candelier, J. J., Breton, C. & Oriol, R. A new superfamily of protein-O-fucosyltransferases, α2-fucosyltransferases, and α6-fucosyltransferases: phylogeny and identification of conserved peptide motifs. Glycobiologie 13, 1C–5C (2003).

Kozma, K. et al. Identification and characterization of a β1,3-glucosyltransferase that synthesizes the Glc-β1,3-Fuc disaccharide on thrombospondin type 1 repeats. J. Biol. Chem. 281, 36742–36751 (2006).

Sato, T. et al. Molecular cloning and characterization of a novel human β1,3-glucosyltransferase, which is localized at the endoplasmic reticulum and glucosylates O-linked fucosylglycan on thrombospondin type 1 repeat domain. Glycobiologie 16, 1194–1206 (2006).

Ricketts, L. M., Dlugosz, M., Luther, K. B., Haltiwanger, R. S. & Majerus, E. M. O-fucosylation is required for ADAMTS13 secretion. J. Biol. Chem. 282, 17014–17023 (2007).

Du, J. et al. O-fucosylation of thrombospondin type 1 repeats restricts epithelial to mesenchymal transition (EMT) and maintains epiblast pluripotency during mouse gastrulation. ontwikkelaar Biol. 346, 25–38 (2010).

Doucey, M. A., Hess, D., Cacan, R. & Hofsteenge, J. Protein C-mannosylation is enzyme-catalysed and uses dolichyl-phosphate-mannose as a precursor. Mol. Biol. Cel 9, 291–300 (1998).

Krieg, J. et al. Recognition signal for C-mannosylation of Trp-7 in RNase 2 consists of sequence Trp-x-x-Trp. Mol. Biol. Cel 9, 301–309 (1998).

Wang, L. W., Leonhard-Melief, C., Haltiwanger, R. S. & Apte, S. S. Post-translational modification of thrombospondin type-1 repeats in ADAMTS-like 1/punctin-1 by C-mannosylation of tryptophan. J. Biol. Chem. 284, 30004–30015 (2009).

Barresi, R. & Campbell, K. P. Dystroglycan: from biosynthesis to pathogenesis of human disease. J. Cel Wetenschap. 119, 199–207 (2006).

Stalnaker, S. H. et al. Glycomic analyses of mouse models of congenital muscular dystrophy. J. Biol. Chem. 286, 21180–21190 (2011). Analyse van O -linked glycans from brains of wild-type and knockout mouse models using mass spectrophotometry to determine that POMGNT1 is required for addition of β1,2-linked GlcNAc on O -Man glycans.

Stalnaker, S. H. et al. Site mapping and characterization of O-glycan structures on α-dystroglycan isolated from rabbit skeletal muscle. J. Biol. Chem. 285, 24882–24891 (2010).

Combs, A. C. & Ervasti, J. M. Enhanced laminin binding by α-dystroglycan after enzymatic deglycosylation. Biochem. J. 390, 303–309 (2005).

Hara, Y. et al. A dystroglycan mutation associated with limb-girdle muscular dystrophy. N. Engl. J. Med. 364, 939–946 (2011).

Yoshida-Moriguchi, T. et al. O-mannosyl phosphorylation of alpha-dystroglycan is required for laminin binding. Wetenschap 327, 88–92 (2010). First description of a novel GAG-like structure containing Xyl and GlcA in unknown linkage to an essential extracellular protein that interacts with the extracellular matrix.

Inamori, K. et al. Dystroglycan function requires xylosyl- and glucuronyltransferase activities of LARGE. Wetenschap 335, 93–96 (2012). Reports the bifunctional glycosyltransferase activity of LARGE1 on O -Man-containing glycans of αDG.

Zhang, Z., Zhang, P. & Hu, H. LARGE expression augments the glycosylation of glycoproteins in addition to α-dystroglycan conferring laminin binding. PLoS ONE 6, e19080 (2011).

Nairn, A. V., dela Rosa, M. & Moremen, K. W. Transcript analysis of stem cells. Methoden Enzymol. 479, 73–91 (2010).

Hua, S. et al. Comprehensive native glycan profiling with isomer separation and quantitation for the discovery of cancer biomarkers. Analyst 136, 3663–3671 (2011).

An, H. J., Kronewitter, S. R., de Leoz, M. L. & Lebrilla, C. B. Glycomics and disease markers. Curr. Opin. Chem. Biol. 13, 601–607 (2009).

Bielik, A. M. & Zaia, J. Historical overview of glycoanalysis. Methoden Mol. Biol. 600, 9–30 (2010).

Aoki, K. et al. The diversity of O-linked glycans expressed during Drosophila melanogaster development reflects stage- and tissue-specific requirements for cell signaling. J. Biol. Chem. 283, 30385–30400 (2008).

Haab, B. B. Antibody-lectin sandwich arrays for biomarker and glycobiology studies. Expert Rev. Proteom. 7, 9–11 (2010).

Yue, T. et al. The prevalence and nature of glycan alterations on specific proteins in pancreatic cancer patients revealed using antibody-lectin sandwich arrays. Mol. Cel. Proteomics 8, 1697–1707 (2009).

Li, C. et al. Pancreatic cancer serum detection using a lectin/glyco-antibody array method. J. Proteome Res. 8, 483–492 (2009).

Adamczyk, B., Tharmalingam, T. & Rudd, P. M. Glycans as cancer biomarkers. Biochim. Biofysica. Acta 9 Dec 2011 (doi:10.1016/j.bbagen.2011.12.001).

Lauc, G. et al. Genomics meets glycomics-the first GWAS study of human N-glycome identifies HNF1α as a master regulator of plasma protein fucosylation. PLoS Genet. 6, e1001256 (2010). Describes the first study that linked high-throughput glycan structural analysis and genome-wide association to identify determinants that control population-specific expression of carbohydrate epitopes.

Huffman, J. E. et al. Polymorphisms in B3GAT1, SLC9A9 and MGAT5 are associated with variation within the human plasma N-glycome of 3533 European adults. Brommen. Mol. Genet. 20, 5000–5011 (2011).

Esko, J. D. & Selleck, S. B. Order out of chaos: assembly of ligand binding sites in heparan sulfate. Ann. ds. Biochem. 71, 435–471 (2002).

Wang, A., de la Motte, C., Lauer, M. & Hascall, V. Hyaluronan matrices in pathobiological processes. FEBS J. 278, 1412–1418 (2011).

Tian, E. & Ten Hagen, K. G. Recent insights into the biological roles of mucin-type O-glycosylation. Glycoconj. J. 26, 325–334 (2009).

Issoglio, F. M., Carrizo, M. E., Romero, J. M. & Curtino, J. A. Mechanisms of monomeric and dimeric glycogenin autoglucosylation. J. Biol. Chem. 287, 1955–1961 (2012).

Schegg, B., Hulsmeier, A. J., Rutschmann, C., Maag, C. & Hennet, T. Core glycosylation of collagen is initiated by two β(1-O)galactosyltransferases. Mol. Cel. Biol. 29, 943–952 (2009).

Pontier, S. M. & Schweisguth, F. Glycosphingolipids in signaling and development: from liposomes to model organisms. ontwikkelaar Dyn. 241, 92–106 (2012).

Farquhar, M. G. & Palade, G. E. The Golgi apparatus: 100 years of progress and controversy. Trends Cell Biol. 8, 2–10 (1998).

Perry, R. J. & Ridgway, N. D. Molecular mechanisms and regulation of ceramide transport. Biochim. Biofysica. Acta 1734, 220–234 (2005).

van Meer, G. & de Kroon, A. I. Lipid map of the mammalian cell. J. Cel Wetenschap. 124, 5–8 (2011).

Smith, M. H., Ploegh, H. L. & Weissman, J. S. Road to ruin: targeting proteins for degradation in the endoplasmic reticulum. Wetenschap 334, 1086–1090 (2011).

Seemann, J., Jokitalo, E., Pypaert, M. & Warren, G. Matrix proteins can generate the higher order architecture of the Golgi apparatus. Natuur 407, 1022–1026 (2000).

Slusarewicz, P., Nilsson, T., Hui, N., Watson, R. & Warren, G. Isolation of a matrix that binds medial Golgi enzymes. J. Cell Biol. 124, 405–413 (1994).

Ramirez, I. B. & Lowe, M. Golgins and GRASPs: holding the Golgi together. Semin. Cell Dev. Biol. 20, 770–779 (2009).

Maccioni, H. J., Quiroga, R. & Spessott, W. Organization of the synthesis of glycolipid oligosaccharides in the Golgi complex. FEBS Lett. 585, 1691–1698 (2011).

Gerken, T. A. et al. Emerging paradigms for the initiation of mucin-type protein O-glycosylation by the polypeptide GalNAc transferase family of glycosyltransferases. J. Biol. Chem. 286, 14493–14507 (2011).

Gupta, R. & Brunak, S. Prediction of glycosylation across the human proteome and the correlation to protein function. Pac. Symp. Biocomput. 2002, 310–322 (2002).

Roch, C., Kuhn, J., Kleesiek, K. & Gotting, C. Differences in gene expression of human xylosyltransferases and determination of acceptor specificities for various proteoglycans. Biochem. Biofysica. Onderzoek gemeenschappelijk 391, 685–691 (2010).

Manya, H. et al. Regulation of mammalian protein O-mannosylation: preferential amino acid sequence for O-mannose modification. J. Biol. Chem. 282, 20200–20206 (2007).

Pierleoni, A., Martelli, P. L. & Casadio, R. PredGPI: a GPI-anchor predictor. BMC Bioinformat. 9, 392 (2008).


Analysis of Proteins That Rapidly Change Upon Mechanistic/Mammalian Target of Rapamycin Complex 1 (mTORC1) Repression Identifies Parkinson Protein 7 (PARK7) as a Novel Protein Aberrantly Expressed in Tuberous Sclerosis Complex (TSC)

Many biological processes involve the mechanistic/mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1). Thus, the challenge of deciphering mTORC1-mediated functions during normal and pathological states in the central nervous system is challenging. Because mTORC1 is at the core of translation, we have investigated mTORC1 function in global and regional protein expression. Activation of mTORC1 has been generally regarded to promote translation. Few but recent works have shown that suppression of mTORC1 can also promote local protein synthesis. Moreover, excessive mTORC1 activation during diseased states represses basal and activity-induced protein synthesis. To determine the role of mTORC1 activation in protein expression, we have used an unbiased, large-scale proteomic approach. We provide evidence that a brief repression of mTORC1 activity in vivo by rapamycin has little effect globally, yet leads to a significant remodeling of synaptic proteins, in particular those proteins that reside in the postsynaptic density. We have also found that curtailing the activity of mTORC1 bidirectionally alters the expression of proteins associated with epilepsy, Alzheimer's disease, and autism spectrum disorder-neurological disorders that exhibit elevated mTORC1 activity. Through a protein-protein interaction network analysis, we have identified common proteins shared among these mTORC1-related diseases. One such protein is Parkinson protein 7, which has been implicated in Parkinson's disease, yet not associated with epilepsy, Alzheimers disease, or autism spectrum disorder. To verify our finding, we provide evidence that the protein expression of Parkinson protein 7, including new protein synthesis, is sensitive to mTORC1 inhibition. Using a mouse model of tuberous sclerosis complex, a disease that displays both epilepsy and autism spectrum disorder phenotypes and has overactive mTORC1 signaling, we show that Parkinson protein 7 protein is elevated in the dendrites and colocalizes with the postsynaptic marker postsynaptic density-95. Our work offers a comprehensive view of mTORC1 and its role in regulating regional protein expression in normal and diseased states.

© 2016 by The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc.


Materialen en methodes

Identifying changes in the proteome during differentiation of THP-1 and C2C12 cells

THP-1 or C2C12 cells were grown in RPMI or DMEM media, respectively, with added 10% dialyzed fetal bovine serum (FBS), 1% glutamine, 1% non-essential amino acids, 1% penicillin/streptomycin and ( L -[U- 13 C6, 14 N4]arginine and L -[ 2 H4]lysine or L -[U- 12 C6, 14 N4]arginine [ 1 H4]lysine or L -[U- 13 C6, 15 N4]arginine and L -[U- 13 C6, 15 N2]lysine (Cambridge Isotope Labs, Cambridge, MA). The cells were grown for at least five doublings to ensure 100% incorporation of labeled amino acids before THP-1 cells were differentiated by 25 nM PMA and C2C12 cells were differentiated by increasing the confluency to 100% while decreasing the serum concentration to 2%.

Peptide separation and MS

The cells were washed three times in PBS and lysed in 1% deoxycholate before being boiled for 5 min. The lysate was digested to peptides as in Rogers and Foster (2007) before being separated by IEF (Agilent Technology) following the manufacturers’ instructions. The separated peptides were STAGE Tipped as in Rappsilber et al (2007) before being analyzed by MS as in Kristensen et al (2012) and proteins were identified and quantified using MaxQuant ( Cox and Mann, 2008 ) with the settings as supplied in Supplementary methods. The mass spectrometry data acquired here have been deposited to the ProteomeXchange Consortium (http://proteomecentral.proteomexchange.org) via the PRIDE partner repository ( Vizcaíno et al, 2013 ) with the data set identifier PXD000328.

Gegevensanalyse

Significantly changing proteins were identified by applying ANOVA between the five time points with the following settings (permutation-based FDR, P=0.05, S0=1, 250 randomizations) using Perseus. Increasing and decreasing proteins were defined by clustering the data into two clusters using fuzzy C mean clustering. Wilcoxon–Mann–Whitney test, partial least regression, and KEN-box motif determination were performed using Matlab (http://www.mathworks.com), whereas correlation coefficients and 2D enrichment analysis (P<0.05, Benjamini-Hochberg FDR for truncation) of the biological processed (Uniprot Keywords) were performed in Perseus, similarly to Cox and Mann (2012) . In boxplots, points were drawn as outliers if they were larger than q3+1.5 (q3−q1) or smaller than q3−1.5 (q3−q1).

Finally, enrichment (Uniprot Keywords) analysis of changing proteins, synthesis and degradation rates were performed by GPROX ( Rigbolt et al, 2011 ) using Fisher's exact test (P<0.05, Benjamini-Hochberg FDR for truncation).


A molecular marker for global protein synthesis - Biology

The Multiple Choice Questions on this site were written by:
Dr Tony Bradshaw, Oxford Brookes University
Dr Shirley McCready, Oxford Brookes University
Dr John Wright, University of Botswana Medical School
Lynne Rogers, Adelaide University

Click on the chapter links below to view the MCQs for each chapter. Please note that there are no MCQs for chapters 1 to 4.

Methods in protein investigation

The cell membrane and membrane proteins

Muscle contraction, the cytoskeleton, and molecular motors

Food digestion, absorption, distribution to the tissues, and appetite control

Mechanisms of transport, storage, and mobilization of dietary components

Principles of energy release from food

Glycolysis, the citric acid cycle, and the electron transport system

Synthesis of fat and related compounds

Synthesis of glucose (gluconeogenesis)

Strategies for metabolic control and their application to carbohydrate and fat metabolism

Why should there be an alternative pathway of glucose oxidation? The pentose phosphate pathway

Raising electrons of water back up the energy scale - photosynthesis

Nucleotide synthesis and metabolism

DNA synthesis, repair, and recombination

Gene transcription and control

Protein synthesis and controlled protein breakdown

The RNA world - RNA microgenes and RNA interference

Protein sorting and delivery

Manipulating DNA and genes

Special topics: blood clotting, xenobiotic metabolism, reactive oxygen species


Bekijk de video: Moleculaire genetica - translatie - HAVOVWO (Januari- 2022).