Informatie

Welke functionele annotaties kunnen nuttig zijn?


Analyse van een genoom, voor een generiek gen, welke functionele annotaties (bijv. van Gene Ontology) kunnen helpen om de betekenis/functie ervan te begrijpen of, op zijn minst, nuttige informatie te verschaffen?

  • Annotaties van dat gen
  • Annotaties van orthologe genen (?)
  • Annotaties van paraloge genen (?)
  • Samen tot expressie gebrachte genen (gegeven een biologische aandoening) (?)
  • Wat nog meer?

Bedankt.


  • Ik zou genetische effecten van het gen en zijn orthologen in die eigen gastheer toevoegen. Knock-outs en overexpressie zijn krachtig in het blootleggen van de functie.
  • In termen van baseline of normale expressie zou ik weefsel, ontwikkelings- of differentiatietijdstippen en omstandigheden toevoegen die expressie stimuleren of onderdrukken.